COL5A1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COL5A1基因编码V型胶原蛋白α1链,是结缔组织的重要结构成分,其突变与埃勒斯-当洛斯综合征(EDS)等遗传性疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 COL5A1
基因全名 collagen type V alpha 1 chain
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q34.3
NCBI Gene ID 1289 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1289
Ensembl ID ENSG00000130635
UniProt ID P20908
OMIM ID 120215
HGNC ID 2209
基因别名 COL5A1, collagen V, alpha-1 polypeptide

基因功能与研究简介

COL5A1基因编码V型胶原蛋白的α1链,V型胶原蛋白是结缔组织中的次要胶原蛋白,与I型胶原蛋白共组装,调节胶原纤维的直径和组装。COL5A1突变与埃勒斯-当洛斯综合征(EDS)经典型相关,表现为皮肤过度伸展、关节过度活动和组织脆弱。此外,COL5A1的异常表达与某些癌症的进展有关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
埃勒斯-当洛斯综合征(经典型) COL5A1基因突变导致V型胶原蛋白结构异常,影响胶原纤维组装,导致结缔组织脆弱。 已明确致病
皮肤松弛症 COL5A1突变可能影响皮肤弹性,但证据有限。 潜在关联
癌症 COL5A1在多种癌症中表达异常,可能促进肿瘤侵袭和转移。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达
肌腱 暂无可靠数据 高表达
骨骼 暂无可靠数据 中等表达
血管 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
成纤维细胞 暂无可靠数据 高表达
平滑肌细胞 暂无可靠数据 中等表达
软骨细胞 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.934G>A (p.Gly312Ser) 错义突变 罕见 可能影响胶原蛋白三螺旋结构,导致功能异常
c.1837C>T (p.Arg613Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,可能引发单倍剂量不足
c.2310delC (p.Gly771AlafsTer5) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,可能引发单倍剂量不足
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

COL5A1突变导致单倍剂量不足或功能丧失,影响V型胶原蛋白的正常组装,是EDS的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明COL5A1突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰正常胶原蛋白的组装。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005201 (extracellular matrix structural constituent) • GO:0005581 (collagen trimer)
• GO:0030198 (extracellular matrix organization) • GO:0005576 (extracellular region)

相关通路

hsa04510 (Focal adhesion)
hsa04512 (ECM-receptor interaction)
hsa04974 (Protein digestion and absorption)

蛋白质功能简介

COL5A1蛋白是V型胶原蛋白的α1链,与α2链(COL5A2)和α3链(COL5A3)组装成V型胶原蛋白异源三聚体。V型胶原蛋白在组织中含量较低,但通过与I型胶原蛋白共组装,调节胶原纤维的直径和排列,对维持结缔组织的结构和功能至关重要。

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