COMMD10基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
COMMD10是COMMD蛋白家族成员,参与NF-κB信号通路调控和铜代谢,与肝细胞癌、结直肠癌等多种肿瘤的发生发展密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | COMMD10 |
|---|---|
| 基因全名 | COMM domain containing 10 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q23.1 |
| NCBI Gene ID | 51313 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51313 |
| Ensembl ID | ENSG00000145782 |
| UniProt ID | Q9Y6G9 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:24022 |
| 基因别名 | PTD012, C5orf7 |
基因功能与研究简介
COMMD10(COMM domain containing 10)是COMMD蛋白家族成员之一,该家族包含10个成员(COMMD1-COMMD10),均含有保守的COMM结构域。COMMD10参与多种细胞过程,包括NF-κB信号通路的负调控、铜代谢、细胞凋亡和DNA损伤修复等。研究表明,COMMD10在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤的发生发展密切相关。此外,COMMD10还参与调节炎症反应和免疫应答。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | COMMD10在肝细胞癌中表达下调,可能通过调控NF-κB信号通路影响肿瘤细胞增殖和凋亡。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | COMMD10在结直肠癌中表达下调,与肿瘤分期和预后相关,可能作为抑癌基因发挥作用。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | COMMD10在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤侵袭和转移。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | COMMD10在非小细胞肺癌中表达下调,可能影响肿瘤细胞生长。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.457C>T (p.Arg153Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响功能 |
| c.632A>G (p.Tyr211Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失或减弱,如无义突变导致的截短蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):突变导致蛋白获得新的或增强的功能,目前COMMD10未见明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):突变蛋白干扰正常蛋白功能,目前COMMD10未见明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007254 (NF-kappaB signaling) | • GO:0006878 (cellular copper ion homeostasis) |
| • GO:0006915 (apoptotic process) | • GO:0006281 (DNA repair) |
相关通路
• NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
• Apoptosis (KEGG: hsa04210)
蛋白质功能简介
COMMD10蛋白属于COMMD家族,包含保守的COMM结构域,该结构域介导蛋白-蛋白相互作用。COMMD10主要定位于细胞质和细胞核,参与NF-κB信号通路的负调控,通过促进NF-κB亚基的泛素化降解来抑制炎症反应。此外,COMMD10还参与铜离子稳态的调节,与铜转运蛋白ATP7A/B相互作用。在肿瘤中,COMMD10表达下调可能解除对NF-κB的抑制,导致炎症和肿瘤进展。