COMMD4基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱

COMMD4是COMMD家族成员,参与NF-κB信号调控和铜代谢,与多种癌症及炎症性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 COMMD4
基因全名 COMM domain containing 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q15.1
NCBI Gene ID 54939 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54939
Ensembl ID ENSG00000140403
UniProt ID Q9P035
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:24017
基因别名 COMMD4, FLJ20035

基因功能与研究简介

COMMD4(COMM domain containing 4)是COMMD蛋白家族成员之一,该家族以含有保守的COMM结构域为特征。COMMD4参与多种细胞过程,包括NF-κB信号通路的调控、铜代谢稳态的维持以及蛋白质降解等。研究表明,COMMD4在多种癌症中表达异常,可能通过影响NF-κB活性而参与肿瘤发生发展。此外,COMMD4还可能与炎症性疾病和代谢性疾病相关。目前,关于COMMD4的功能研究仍在深入进行中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 COMMD4在肝细胞癌中高表达,可能通过激活NF-κB信号通路促进肿瘤进展。 较强研究证据
结直肠癌 COMMD4在结直肠癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控NF-κB影响肿瘤细胞增殖和凋亡。 较强研究证据
乳腺癌 COMMD4在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤转移和耐药。 潜在关联
炎症性肠病 COMMD4可能通过调节NF-κB活性影响肠道炎症反应。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.457C>T (p.Arg153Ter) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.638A>G (p.Gln213Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变导致蛋白截短,可能丧失功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005634 nucleus • GO:0007254 JNK cascade
• GO:0006878 cellular copper ion homeostasis • GO:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling

相关通路

NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
Copper homeostasis (Reactome: R-HSA-936837)

蛋白质功能简介

COMMD4蛋白属于COMMD家族,包含保守的COMM结构域,该结构域介导蛋白-蛋白相互作用。COMMD4定位于细胞质和细胞核,参与NF-κB信号通路的负调控,通过促进IκBα降解或影响NF-κB亚基的核转位来调节炎症反应。此外,COMMD4还参与铜代谢稳态的维持,可能通过调节铜转运蛋白的降解来影响细胞内铜水平。在癌症中,COMMD4的异常表达可能通过激活NF-κB信号促进肿瘤进展。

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