COMMD7基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
COMMD7是COMMD蛋白家族成员,参与NF-κB信号通路调控和铜代谢,与肝细胞癌等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | COMMD7 |
|---|---|
| 基因全名 | COMM domain containing 7 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20q11.22 |
| NCBI Gene ID | 149951 ncbi.nlm.nih.gov/gene/149951 |
| Ensembl ID | ENSG00000101442 |
| UniProt ID | Q86VX2 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | 24022 |
| 基因别名 | C20orf92, bA137P22.2 |
基因功能与研究简介
COMMD7是COMMD蛋白家族成员,该家族蛋白以COMM结构域为特征,参与多种细胞过程,包括NF-κB信号通路调控、铜代谢和蛋白质稳态。COMMD7在多种组织中表达,尤其在肝脏中高表达。研究表明COMMD7在肝细胞癌中表达上调,可能通过调控NF-κB信号通路促进肿瘤进展。此外,COMMD7还参与DNA损伤修复和细胞凋亡等过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | COMMD7在肝细胞癌中表达上调,可能通过激活NF-κB信号通路促进肿瘤细胞增殖和侵袭。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | COMMD7在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。 | 潜在关联 |
| 其他癌症 | COMMD7在多种癌症中表达异常,但具体作用机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.416C>T (p.Pro139Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.538A>G (p.Ile180Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0007250 activation of NF-kappaB transcription factor |
| • GO:0006878 cellular copper ion homeostasis | • GO:0005737 cytoplasm |
相关通路
• NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
• Copper metabolism (Reactome: R-HSA-936837)
蛋白质功能简介
COMMD7蛋白属于COMMD家族,包含一个保守的COMM结构域,该结构域介导蛋白-蛋白相互作用。COMMD7通过调控NF-κB信号通路参与炎症反应和细胞存活,并在铜代谢中发挥作用。在肝细胞癌中,COMMD7高表达可能通过增强NF-κB活性促进肿瘤进展。