COMP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COMP基因编码软骨寡聚基质蛋白,是软骨细胞外基质的重要成分,其突变可导致多种骨骼发育不良疾病。

基因信息卡

基因符号 COMP
基因全名 cartilage oligomeric matrix protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.11
NCBI Gene ID 1311 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1311
Ensembl ID ENSG00000105664
UniProt ID P49747
OMIM ID 600310
HGNC ID 2227
基因别名 EDM1, EPD1, MED, PSACH, THBS5

基因功能与研究简介

COMP基因编码软骨寡聚基质蛋白,属于凝血酶敏感蛋白家族。该蛋白是软骨细胞外基质的重要成分,参与软骨细胞与基质间的相互作用,对软骨的发育和稳态维持至关重要。COMP基因突变可导致多种骨骼发育不良疾病,包括多发性骨骺发育不良和假性软骨发育不全。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
多发性骨骺发育不良 COMP基因突变导致蛋白结构异常,影响软骨细胞外基质的组装和功能,进而导致骨骺发育异常。 已明确致病
假性软骨发育不全 COMP基因突变导致蛋白功能丧失或显性负效应,影响软骨发育,导致身材矮小和骨骼畸形。 已明确致病
骨关节炎 COMP蛋白在骨关节炎中表达上调,可能作为疾病进展的生物标志物,但基因突变与骨关节炎的直接因果关系证据不足。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
软骨 暂无可靠数据 高表达
肌腱 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
软骨细胞 暂无可靠数据 高表达
成纤维细胞 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1129G>A (p.Asp377Asn) 错义突变 未知 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.1543C>T (p.Arg515Cys) 错义突变 未知 可能影响蛋白折叠,导致功能丧失
c.1663G>A (p.Gly555Arg) 错义突变 未知 可能影响蛋白与配体结合,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致COMP蛋白功能缺失或降低,影响软骨基质完整性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明COMP突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负效应突变:突变蛋白干扰正常蛋白功能,导致软骨发育异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005576 (extracellular region)
• GO:0005615 (extracellular space) • GO:0031012 (extracellular matrix)
• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0008201 (heparin binding)

相关通路

ECM-receptor interaction (hsa04512)
Focal adhesion (hsa04510)
PI3K-Akt signaling pathway (hsa04151)

蛋白质功能简介

COMP蛋白是由五个亚基组成的五聚体,属于凝血酶敏感蛋白家族。该蛋白主要表达于软骨、肌腱和韧带等结缔组织中,通过与胶原蛋白、基质蛋白等相互作用,参与细胞外基质的组装和稳定。COMP蛋白在软骨发育和维持中发挥重要作用,其突变可导致骨骼发育不良疾病。

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