COP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COP1(E3泛素连接酶)在蛋白质降解、DNA损伤修复和肿瘤抑制中发挥关键作用,其突变与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 COP1
基因全名 COP1 E3 ubiquitin ligase
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q25.2
NCBI Gene ID 114769 ncbi.nlm.nih.gov/gene/114769
Ensembl ID ENSG00000143799
UniProt ID Q8NHY2
OMIM ID 608897
HGNC ID 2230
基因别名 RFWD2, DEDAF, FLJ10410

基因功能与研究简介

COP1(E3泛素连接酶)是RING finger型E3泛素连接酶,通过泛素-蛋白酶体途径降解底物蛋白,参与调控细胞周期、DNA损伤修复、转录调控等过程。COP1在多种肿瘤中表达异常,其突变或缺失可导致基因组不稳定和肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 已明确致病 ClinVar
前列腺癌 已明确致病 ClinVar
黑色素瘤 已明确致病 ClinVar
肺癌 具有较强研究证据 COSMIC
结直肠癌 具有较强研究证据 COSMIC
肝癌 潜在关联 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
PC3 暂无可靠数据 前列腺癌细胞系
A375 暂无可靠数据 黑色素瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 0.5% 可能影响蛋白稳定性
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 0.1% 导致功能丧失
c.890T>C (p.Leu297Pro) 错义突变 0.2% 可能影响底物结合
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致COP1蛋白活性降低或缺失,影响底物降解,促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,增强COP1活性,可能促进肿瘤进展,但证据有限。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白干扰野生型COP1功能,导致细胞周期异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006281 (DNA repair)

相关通路

hsa04120 (Ubiquitin mediated proteolysis)
hsa03430 (Mismatch repair)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

COP1蛋白包含RING finger结构域和WD40重复序列,作为E3泛素连接酶,介导底物蛋白的泛素化降解。COP1参与调控p53、c-Jun等关键蛋白的稳定性,影响细胞凋亡和细胞周期。在多种肿瘤中,COP1表达下调或突变,导致其抑癌功能丧失。

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