COPA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COPA基因编码外壳蛋白复合物亚基α,参与细胞内囊泡运输,其突变与自身炎症性肺病和肾病相关。

基因信息卡

基因符号 COPA
基因全名 COPI coat complex subunit alpha
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q23.2
NCBI Gene ID 1314 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1314
Ensembl ID ENSG00000122218
UniProt ID P53621
OMIM ID 601924
HGNC ID 2230
基因别名 HEP-COP, AIFEC, alpha-COP

基因功能与研究简介

COPA基因编码外壳蛋白复合物I(COPI)的α亚基,该复合物介导高尔基体与内质网之间的囊泡运输。COPA蛋白包含WD40重复结构域,参与囊泡外壳的形成和货物识别。COPA突变(多为错义突变)导致常染色体显性遗传的自身炎症性疾病,称为COPA综合征,以肺部、关节和肾脏受累为特征。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
COPA综合征 COPA基因错义突变导致蛋白功能异常,影响内质网-高尔基体运输,触发未折叠蛋白反应和炎症通路,导致自身炎症反应。 已明确致病(OMIM 616414)
间质性肺病 COPA综合征的常见表现,表现为肺间质炎症和纤维化。 已明确致病(OMIM 616414)
关节炎 COPA综合征的关节表现,常为类风湿因子阴性。 已明确致病(OMIM 616414)
肾病 COPA综合征的肾脏表现,包括血尿、蛋白尿和肾功能不全。 已明确致病(OMIM 616414)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
关节滑膜 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.698G>A (p.Arg233His) 错义突变 未知 可能影响蛋白功能,导致COPA综合征
c.721G>A (p.Glu241Lys) 错义突变 未知 可能影响蛋白功能,导致COPA综合征
c.733G>A (p.Glu245Lys) 错义突变 未知 可能影响蛋白功能,导致COPA综合征
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

COPA突变可能通过显性负效应干扰COPI复合物功能,导致囊泡运输异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005198 (structural molecule activity) • GO:0006886 (intracellular protein transport)
• GO:0016192 (vesicle-mediated transport) • GO:0000139 (Golgi membrane)
• GO:0030126 (COPI vesicle coat)

相关通路

COPI-mediated vesicle transport (Reactome: R-HSA-6811436)
ER to Golgi transport (Reactome: R-HSA-6811440)

蛋白质功能简介

COPA蛋白是COPI外壳复合物的α亚基,该复合物在细胞内膜系统中介导从高尔基体到内质网的逆行运输。COPA蛋白包含WD40重复结构域,参与蛋白-蛋白相互作用和货物识别。COPA突变导致蛋白功能异常,可能通过显性负效应干扰COPI复合物组装,进而影响内质网-高尔基体运输,触发未折叠蛋白反应和炎症通路,导致COPA综合征。

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