COPE基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COPE基因编码ε-COP蛋白,是COPI囊泡运输复合体的重要亚基,参与高尔基体与内质网之间的蛋白质运输,其功能障碍与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 COPE
基因全名 COPI coat complex subunit epsilon
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.32
NCBI Gene ID 11316 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11316
Ensembl ID ENSG00000105669
UniProt ID O14579
OMIM ID 606942
HGNC ID 2230
基因别名 EPSILON-COP, COPI, MGC104233

基因功能与研究简介

COPE基因编码ε-COP蛋白,是COPI(外壳蛋白复合物I)的亚基之一。COPI囊泡负责从高尔基体顺面到内质网的蛋白质和脂质逆向运输,以及高尔基体内部的运输。ε-COP在COPI复合物的组装和稳定性中起关键作用,可能参与囊泡形成和货物选择。COPE基因突变可能导致蛋白质运输异常,进而影响细胞功能,与某些遗传性疾病和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性痉挛性截瘫 COPE基因突变可能导致遗传性痉挛性截瘫,但具体机制尚不明确,可能与神经元中蛋白质运输异常有关。 ClinVar
癌症 COPE在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤细胞的增殖和转移,但具体机制仍在研究中。 COSMIC
暂无明确证据 暂无可靠数据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456C>T (p.Arg152Ter) 无义突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能使COPI复合体功能受损,影响囊泡运输。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005198 (structural molecule activity) • GO:0006886 (intracellular protein transport)
• GO:0016192 (vesicle-mediated transport) • GO:0030126 (COPI vesicle coat)
• GO:0005794 (Golgi apparatus)

相关通路

COPI-mediated transport (Reactome: R-HSA-199977)
Membrane trafficking (KEGG: hsa04144)

蛋白质功能简介

ε-COP蛋白是COPI复合体的一个亚基,分子量约为34 kDa。它包含一个WD40重复结构域,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。ε-COP在COPI复合体的组装中起重要作用,可能通过与其他亚基的相互作用稳定复合体结构。此外,ε-COP可能参与货物识别和囊泡形成。

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