CRAT基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CRAT基因编码肉碱O-乙酰转移酶,在脂肪酸代谢和能量稳态中发挥关键作用,其突变与多种代谢性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CRAT |
|---|---|
| 基因全名 | carnitine O-acetyltransferase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q34.11 |
| NCBI Gene ID | 1384 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1384 |
| Ensembl ID | ENSG00000095321 |
| UniProt ID | P43155 |
| OMIM ID | 600184 |
| HGNC ID | 2342 |
| 基因别名 | CATC, CPT1, carnitine acetylase |
基因功能与研究简介
CRAT基因编码肉碱O-乙酰转移酶,该酶催化乙酰辅酶A与肉碱之间的可逆反应,生成乙酰肉碱和辅酶A,在脂肪酸代谢、能量稳态和线粒体功能中发挥关键作用。CRAT主要存在于线粒体基质中,也存在于过氧化物酶体和内质网中,参与多种代谢途径的调节。CRAT基因突变可能导致肉碱酰基转移酶缺乏症,影响脂肪酸氧化,并与糖尿病、肥胖等代谢性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肉碱酰基转移酶缺乏症 | 已明确致病 | OMIM |
| 糖尿病 | 具有较强研究证据 | ClinVar |
| 肥胖 | 具有较强研究证据 | ClinVar |
| 癌症 | 潜在关联 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| C2C12 | 暂无可靠数据 | 小鼠成肌细胞 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.136C>T (p.Arg46Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.533G>A (p.Arg178His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
| c.1003C>T (p.Arg335Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致CRAT酶活性降低或缺失,影响脂肪酸代谢,可能引起代谢紊乱。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CRAT存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CRAT存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004095 carnitine O-acetyltransferase activity | • GO:0005739 mitochondrion |
| • GO:0005777 peroxisome | • GO:0006635 fatty acid beta-oxidation |
| • GO:0019432 triglyceride biosynthetic process |
相关通路
• hsa00071 Fatty acid degradation
• hsa00280 Valine
• leucine and isoleucine degradation
• hsa00640 Propanoate metabolism
• hsa01212 Fatty acid metabolism
蛋白质功能简介
CRAT蛋白由626个氨基酸组成,分子量约为70 kDa。该蛋白主要定位于线粒体基质,也存在于过氧化物酶体和内质网中。CRAT催化乙酰辅酶A与肉碱之间的可逆反应,生成乙酰肉碱和辅酶A,从而调节线粒体内乙酰辅酶A/辅酶A比值,影响脂肪酸氧化和能量代谢。CRAT还参与过氧化物酶体中的脂肪酸β-氧化,以及支链氨基酸的分解代谢。CRAT蛋白的异常表达或突变与多种代谢性疾病相关。