CSF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CSF1基因编码巨噬细胞集落刺激因子,调控单核/巨噬细胞的增殖、分化与存活,在炎症、肿瘤及骨代谢中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | CSF1 |
|---|---|
| 基因全名 | colony stimulating factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p13.3 |
| NCBI Gene ID | 1435 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1435 |
| Ensembl ID | ENSG00000184371 |
| UniProt ID | P09603 |
| OMIM ID | 120420 |
| HGNC ID | 2432 |
| 基因别名 | MCSF, M-CSF, CSF-1 |
基因功能与研究简介
CSF1基因编码巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF),是一种细胞因子,通过结合其受体CSF1R调控单核细胞、巨噬细胞和破骨细胞的增殖、分化、存活和功能。CSF1在免疫应答、炎症、骨代谢和肿瘤发生中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 弥漫性腱鞘巨细胞瘤 | CSF1基因重排导致CSF1过表达,驱动肿瘤细胞增殖和巨噬细胞浸润,已明确致病。 | OMIM, COSMIC |
| 成人型破骨细胞瘤 | CSF1过表达促进破骨细胞活化,与肿瘤相关骨溶解有关,具有较强研究证据。 | OMIM, PubMed |
| 慢性炎症性疾病 | CSF1水平升高与类风湿关节炎、动脉粥样硬化等慢性炎症相关,潜在关联。 | PubMed |
| 癌症相关巨噬细胞浸润 | CSF1在多种实体瘤中高表达,促进肿瘤相关巨噬细胞(TAM)浸润,与不良预后相关,具有较强研究证据。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 单核细胞 | 暂无可靠数据 | CSF1在单核细胞中表达 |
| 巨噬细胞 | 暂无可靠数据 | CSF1在巨噬细胞中表达 |
| 成纤维细胞 | 暂无可靠数据 | CSF1在成纤维细胞中表达 |
| 肿瘤细胞系 | 暂无可靠数据 | 部分肿瘤细胞系表达CSF1 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| CSF1基因重排 | 结构变异 | 罕见 | 导致CSF1过表达,与弥漫性腱鞘巨细胞瘤相关 |
| CSF1 c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 功能影响未知,暂无明确证据 |
| CSF1 c.567C>T (p.Arg189Trp) | 错义突变 | 罕见 | 功能影响未知,暂无明确证据 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
CSF1功能缺失突变可能导致巨噬细胞发育缺陷,但目前在人类中尚无明确致病性证据。
Gain of Function(功能获得,GOF)
CSF1基因重排导致过表达,属于功能获得性突变,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CSF1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005125 (cytokine activity) | • GO:0008083 (growth factor activity) |
| • GO:0005615 (extracellular space) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0048011 (receptor signaling pathway via JAK-STAT) | • GO:0033005 (positive regulation of mast cell activation) |
相关通路
• hsa04620 (Toll-like receptor signaling pathway)
• hsa04630 (JAK-STAT signaling pathway)
• hsa04640 (Hematopoietic cell lineage)
• hsa05142 (Chagas disease)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
CSF1蛋白(M-CSF)是一种分泌型细胞因子,由224个氨基酸组成,包含信号肽、细胞因子结构域和跨膜区。它通过结合CSF1R受体激活下游信号通路,如PI3K/AKT、MAPK和JAK/STAT,调控巨噬细胞的增殖、分化和存活。CSF1在免疫调节、骨代谢和肿瘤微环境中发挥关键作用。
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