CSTF3基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

CSTF3是mRNA 3'末端加工关键因子,其突变与神经发育障碍相关,并在癌症中异常表达。

基因信息卡

基因符号 CSTF3
基因全名 cleavage stimulation factor subunit 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 11p13
NCBI Gene ID 1479 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1479
Ensembl ID ENSG00000176102
UniProt ID Q12996
OMIM ID 600367
HGNC ID 2484
基因别名 CSTF3, CstF-77, CstF77, KIAA0753

基因功能与研究简介

CSTF3(cleavage stimulation factor subunit 3)编码mRNA 3'末端加工复合物CstF的77 kDa亚基,参与pre-mRNA的切割和多聚腺苷酸化。该基因在RNA加工中起关键作用,影响基因表达调控。CSTF3突变与神经发育障碍相关,并在多种癌症中异常表达,提示其在肿瘤发生中的潜在作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 CSTF3突变导致mRNA加工异常,影响神经发育相关基因表达,可能致病。 ClinVar
癌症 CSTF3在多种癌症中表达上调,可能通过影响mRNA加工促进肿瘤发生。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变导致蛋白截短,功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0031124 mRNA 3'-end processing

相关通路

mRNA 3'-end processing (Reactome: R-HSA-72163)
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region (Reactome: R-HSA-72172)

蛋白质功能简介

CSTF3蛋白是CstF复合物的77 kDa亚基,与CSTF1和CSTF2形成异源三聚体,结合pre-mRNA的G/U-rich序列,促进切割和多聚腺苷酸化。该蛋白在细胞核中定位,参与mRNA成熟过程。

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