CTDP1基因|基因功能、疾病关联、突变与RNA聚合酶II转录调控研究

CTDP1基因编码RNA聚合酶II羧基末端结构域磷酸酶,参与转录调控,其突变可导致先天性白内障、面部畸形、神经病变综合征(CCFDN)。

基因信息卡

基因符号 CTDP1
基因全名 CTDP1 phosphatase subunit 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 18q23
NCBI Gene ID 9150 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9150
Ensembl ID ENSG00000141456
UniProt ID Q9Y2B0
OMIM ID 604927
HGNC ID 2498
基因别名 FCP1, CCFDN

基因功能与研究简介

CTDP1基因编码RNA聚合酶II最大亚基羧基末端结构域(CTD)的磷酸酶,通过去磷酸化CTD的Ser2和Ser5残基,调控转录延伸和终止。CTDP1在转录调控中发挥关键作用,其功能异常与先天性白内障、面部畸形、神经病变综合征(CCFDN)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
先天性白内障、面部畸形、神经病变综合征(CCFDN) CTDP1基因突变导致CTDP1蛋白功能缺失或异常,影响RNA聚合酶II的转录调控,进而导致神经发育异常和眼部、面部畸形。 已明确致病(OMIM 604927)
腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Tooth disease) 部分CTDP1突变可能影响周围神经髓鞘形成,但证据有限。 潜在关联(ClinVar)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.863A>G (p.Gln288Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与CCFDN相关(ClinVar)
c.1567C>T (p.Arg523Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能缺失(ClinVar)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

CTDP1突变导致蛋白功能缺失或降低,影响RNA聚合酶II CTD去磷酸化,导致转录调控异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008420 (RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006368 (transcription elongation from RNA polymerase II promoter)

相关通路

RNA polymerase II transcription (Reactome: R-HSA-73857)

蛋白质功能简介

CTDP1蛋白(FCP1)是RNA聚合酶II转录调控的关键磷酸酶,特异性去磷酸化CTD的Ser2和Ser5。它参与转录延伸和终止,并与多种转录因子相互作用。CTDP1突变导致CCFDN综合征,表现为先天性白内障、面部畸形、周围神经病变等。

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