CWC27基因|剪接体组分、视网膜变性、骨骼异常与突变研究
CWC27编码剪接体相关蛋白,参与前体mRNA剪接,其突变与视网膜变性、骨骼异常等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CWC27 |
|---|---|
| 基因全名 | CWC27 spliceosome associated protein homolog |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q12.3 |
| NCBI Gene ID | 10284 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10284 |
| Ensembl ID | ENSG00000153015 |
| UniProt ID | Q6UX04 |
| OMIM ID | 617711 |
| HGNC ID | 25864 |
| 基因别名 | CWC27, SDCCAG10, NY-CO-10 |
基因功能与研究简介
CWC27基因编码剪接体相关蛋白,是剪接体复合物的组成部分,参与前体mRNA的剪接过程。该蛋白含有肽基脯氨酰异构酶(PPIase)结构域,可能参与剪接调控。CWC27突变与视网膜变性、骨骼异常等疾病相关,但具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 视网膜变性伴骨骼异常 | CWC27突变导致剪接异常,影响视网膜和骨骼发育相关基因的表达,但具体机制尚不明确。 | ClinVar, OMIM |
| 色素性视网膜炎 | 部分CWC27突变与色素性视网膜炎相关,可能通过影响视网膜细胞剪接导致感光细胞死亡。 | ClinVar |
| 骨骼发育异常 | CWC27突变可导致骨骼发育异常,如脊柱骨骺发育不良,机制可能与剪接异常影响软骨和骨形成相关基因有关。 | OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.507dupA (p.Glu170Argfs*5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1186C>T (p.Arg396*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1255G>A (p.Gly419Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致蛋白功能丧失或截短,影响剪接体功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005681 spliceosomal complex | • GO:0006397 mRNA processing |
| • GO:0008380 RNA splicing | • GO:0003755 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity |
相关通路
• Spliceosome (KEGG: hsa03040)
蛋白质功能简介
CWC27蛋白是剪接体相关蛋白,含有肽基脯氨酰异构酶(PPIase)结构域,可能参与剪接调控。该蛋白在多种组织中表达,但具体表达水平暂无可靠数据。CWC27突变可导致剪接异常,进而影响相关基因表达,导致疾病。