CXCL17基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
CXCL17是一种趋化因子,参与黏膜免疫和血管生成,与多种炎症性疾病和肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CXCL17 |
|---|---|
| 基因全名 | C-X-C motif chemokine ligand 17 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19q13.2 |
| NCBI Gene ID | 284340 ncbi.nlm.nih.gov/gene/284340 |
| Ensembl ID | ENSG00000184203 |
| UniProt ID | Q6UXB2 |
| OMIM ID | 611458 |
| HGNC ID | 19234 |
| 基因别名 | VCC-1; DMC; UNQ473 |
基因功能与研究简介
CXCL17(C-X-C motif chemokine ligand 17)是一种趋化因子,属于CXC趋化因子家族。它主要在黏膜组织(如肺、胃、肠道)中高表达,参与免疫细胞募集、血管生成和黏膜防御。CXCL17通过与其受体GPR35结合,调节巨噬细胞和树突状细胞的功能。研究表明,CXCL17在多种炎症性疾病和肿瘤中异常表达,可能作为潜在的生物标志物或治疗靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 炎症性肠病 | CXCL17在肠道炎症中表达上调,可能通过调节巨噬细胞浸润参与疾病进展。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | CXCL17在胃癌组织中高表达,与肿瘤血管生成和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | CXCL17表达水平与肿瘤分期和转移相关,可能促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | CXCL17在肝癌中表达升高,可能通过促进血管生成影响肿瘤生长。 | 潜在关联 |
| 非小细胞肺癌 | CXCL17在肺癌中表达异常,可能参与肿瘤免疫逃逸。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs2014300 | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响基因表达调控 |
| rs11762213 | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响剪接 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008009 (chemokine activity) | • GO:0005615 (extracellular space) |
| • GO:0006955 (immune response) | • GO:0001525 (angiogenesis) |
相关通路
• hsa04062 (Chemokine signaling pathway)
• hsa04620 (Toll-like receptor signaling pathway)
蛋白质功能简介
CXCL17蛋白是一种分泌型趋化因子,包含CXC基序,但缺乏ELR基序。它通过G蛋白偶联受体GPR35发挥作用,参与免疫细胞趋化、血管生成和组织修复。CXCL17在黏膜组织中高表达,可能通过调节巨噬细胞和树突状细胞的功能来维持免疫稳态。在肿瘤微环境中,CXCL17可能促进肿瘤血管生成和免疫抑制。