CYLD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CYLD基因编码去泛素化酶,负调控NF-κB信号通路,其突变与多种皮肤肿瘤和炎症性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CYLD |
|---|---|
| 基因全名 | CYLD lysine 63 deubiquitinase |
| 基因类型 | protein-coding gene |
| 染色体位置 | 16q12.1 |
| NCBI Gene ID | 1540 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1540 |
| Ensembl ID | ENSG00000083799 |
| UniProt ID | Q9NQC7 |
| OMIM ID | 605018 |
| HGNC ID | 2584 |
| 基因别名 | CYLD1, CYLD2, EAC, MFT, SBS, USPL2 |
基因功能与研究简介
CYLD基因编码一种去泛素化酶,属于泛素羧基末端水解酶家族。该酶通过去除底物蛋白上的K63连接的泛素链,负调控NF-κB信号通路、JNK信号通路等,从而调节炎症反应、细胞增殖和凋亡。CYLD基因突变可导致功能丧失,引起多种皮肤附属器肿瘤,如圆柱瘤、毛发上皮瘤等,并可能增加肿瘤易感性。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 家族性圆柱瘤病 | CYLD基因功能丧失性突变导致NF-κB信号通路过度激活,促进肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 多发性毛发上皮瘤 | CYLD基因突变导致毛发上皮异常增生,与NF-κB通路失调有关。 | 已明确致病 |
| Brooke-Spiegler综合征 | CYLD基因突变导致多发性皮肤肿瘤,包括圆柱瘤、毛发上皮瘤和汗腺腺瘤。 | 已明确致病 |
| CYLD相关皮肤综合征 | CYLD基因突变导致多种皮肤肿瘤,可能涉及其他信号通路。 | 具有较强研究证据 |
| 炎症性肠病 | CYLD基因多态性可能影响NF-κB活性,与炎症性肠病风险相关。 | 潜在关联 |
| 肝细胞癌 | CYLD表达下调或突变可能促进肝癌发生,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 免疫组织 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1112C>A (p.Ser371*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2350C>T (p.Arg784*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2806C>T (p.Arg936*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2179C>T (p.Arg727*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2469delA (p.Glu823fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致CYLD蛋白截短或降解,失去去泛素化酶活性,无法正常负调控NF-κB等信号通路,从而促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CYLD存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CYLD突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 - cysteine-type deubiquitinase activity | • GO:0005737 - cytoplasm |
| • GO:0005829 - cytosol | • GO:0007250 - activation of NF-kappaB transcription factor |
| • GO:0043123 - positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling | • GO:0006915 - apoptotic process |
| • GO:0008283 - cell population proliferation |
相关通路
• NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
• TNF signaling pathway (KEGG: hsa04668)
• Toll-like receptor signaling pathway (KEGG: hsa04620)
• RIG-I-like receptor signaling pathway (KEGG: hsa04622)
蛋白质功能简介
CYLD蛋白由956个氨基酸组成,包含三个细胞骨架相关蛋白(CAP-Gly)结构域和一个催化结构域。它主要定位在细胞质中,通过去除底物蛋白上的K63连接的泛素链,抑制NF-κB信号通路的激活。CYLD还参与调控JNK、Wnt等信号通路,影响细胞增殖、凋亡和炎症反应。CYLD蛋白的异常表达或功能丧失与多种肿瘤和炎症性疾病相关。