DCHS1基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
DCHS1编码钙粘蛋白超家族成员,参与细胞粘附与组织形态发生,其突变与MVR综合征及多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DCHS1 |
|---|---|
| 基因全名 | dachsous cadherin-related 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p15.4 |
| NCBI Gene ID | 8642 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8642 |
| Ensembl ID | ENSG00000166341 |
| UniProt ID | Q96JQ0 |
| OMIM ID | 603057 |
| HGNC ID | 21432 |
| 基因别名 | CDH19, CDHR19, FIB1, PCDH16 |
基因功能与研究简介
DCHS1基因编码一种非典型钙粘蛋白,属于钙粘蛋白超家族。该蛋白在细胞粘附、细胞迁移和组织形态发生中发挥重要作用。DCHS1在发育过程中广泛表达,尤其在心脏、肾脏和神经系统。其突变与MVR综合征(先天性二尖瓣脱垂)相关,并可能参与多种癌症的发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| MVR综合征(二尖瓣脱垂综合征) | DCHS1突变导致蛋白功能异常,影响心脏瓣膜发育,导致二尖瓣脱垂。 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | DCHS1表达下调或突变可能促进肿瘤进展,但具体机制尚在研究中。 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | DCHS1在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤抑制,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7(乳腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HCT116(结直肠癌细胞系) | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.7465C>T (p.Arg2489Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.5320G>A (p.Asp1774Asn) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变导致截短蛋白,可能通过无义介导的mRNA降解或产生无功能蛋白,导致单倍剂量不足。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明DCHS1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):部分错义突变可能干扰正常蛋白功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) | • GO:0005509 (calcium ion binding) |
| • GO:0016020 (membrane) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• hsa04514 (Cell adhesion molecules)
• hsa04390 (Hippo signaling pathway)
蛋白质功能简介
DCHS1蛋白是一种非典型钙粘蛋白,包含多个钙粘蛋白重复结构域、一个跨膜区和一个胞内结构域。它参与细胞间粘附,并通过与Fat4等蛋白相互作用调节Hippo信号通路,影响细胞增殖和凋亡。在发育过程中,DCHS1对组织形态发生至关重要。