DCLRE1C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
DCLRE1C基因编码Artemis蛋白,是DNA双链断裂修复和V(D)J重组的关键因子,其突变导致严重联合免疫缺陷(SCID)及相关疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | DCLRE1C |
|---|---|
| 基因全名 | DNA cross-link repair 1C |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10p13 |
| NCBI Gene ID | 64421 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64421 |
| Ensembl ID | ENSG00000152457 |
| UniProt ID | Q96SD1 |
| OMIM ID | 605988 |
| HGNC ID | 17666 |
| 基因别名 | ARTEMIS, SNM1C, SCIDA, A-SCID |
基因功能与研究简介
DCLRE1C基因编码Artemis蛋白,属于金属-β-内酰胺酶/β-CASP家族,具有核酸内切酶活性。Artemis在DNA双链断裂修复(特别是非同源末端连接,NHEJ)和V(D)J重组中发挥关键作用,参与T细胞和B细胞受体基因的重排。DCLRE1C基因突变可导致Artemis蛋白功能缺失,引起常染色体隐性遗传的严重联合免疫缺陷(SCID),表现为T细胞和B细胞缺乏,但NK细胞正常(T-B-NK+ SCID)。此外,DCLRE1C突变还与放射敏感性增加和某些癌症风险相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 严重联合免疫缺陷(SCID) | DCLRE1C基因突变导致Artemis蛋白功能缺失,影响V(D)J重组和DNA修复,导致T、B淋巴细胞发育障碍,引起T-B-NK+ SCID。 | 已明确致病 |
| 放射敏感性 | Artemis缺陷细胞对电离辐射敏感,DNA双链断裂修复受损,导致放射敏感性增加。 | 具有较强研究证据 |
| 自身免疫性疾病 | 部分DCLRE1C突变患者可能表现为自身免疫现象,但机制尚不完全清楚。 | 潜在关联 |
| 癌症风险 | DCLRE1C突变可能增加淋巴瘤等癌症风险,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达于造血组织 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | T细胞发育关键组织 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 免疫器官 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 免疫器官 |
| 外周血白细胞 | 暂无可靠数据 | 淋巴细胞表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| GM12878(B淋巴细胞) | 暂无可靠数据 | B细胞系 |
| K562(慢性粒细胞白血病) | 暂无可靠数据 | 髓系细胞系 |
| Jurkat(T细胞白血病) | 暂无可靠数据 | T细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.597C>T (p.Arg199Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1700_1701del (p.Glu567ValfsTer2) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1145G>A (p.Trp382Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1186C>T (p.Arg396Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1271T>C (p.Leu424Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数DCLRE1C致病突变导致Artemis蛋白功能缺失,包括无义突变、移码突变和剪接位点突变,导致蛋白截短或降解,丧失核酸内切酶活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明DCLRE1C存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明DCLRE1C突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004519 (endonuclease activity) | • GO:0006303 (double-strand break repair via nonhomologous end joining) |
| • GO:0006310 (V(D)J recombination) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005654 (nucleoplasm) | • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• Non-homologous end joining (NHEJ) - Homo sapiens (human) (WP455)
• V(D)J recombination (WP449)
蛋白质功能简介
Artemis蛋白由DCLRE1C基因编码,包含一个金属-β-内酰胺酶结构域和一个β-CASP结构域,具有单链DNA核酸内切酶活性。在DNA双链断裂修复中,Artemis与DNA-PKcs结合,在断裂末端进行修剪,促进NHEJ。在V(D)J重组中,Artemis负责打开发夹结构,产生编码连接。Artemis缺陷导致免疫缺陷和放射敏感性。