DDRGK1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

DDRGK1编码一个参与Ufm1修饰系统的关键蛋白,其突变与Shohat型脊柱干骺端发育不良相关,并在内质网应激和骨发育中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 DDRGK1
基因全名 DDRGK domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 chr20:3,177,000-3,190,000 (GRCh38)
NCBI Gene ID 65992 ncbi.nlm.nih.gov/gene/65992
Ensembl ID ENSG00000101210
UniProt ID Q96HY6
OMIM ID 617082
HGNC ID 24910
基因别名 C20orf116, FLJ20489

基因功能与研究简介

DDRGK1(DDRGK domain containing 1)基因编码一个含有DDRGK结构域的蛋白质,该蛋白是Ufm1(泛素折叠修饰物1)特异性连接酶UFL1的底物,参与Ufm1修饰系统。DDRGK1在内质网稳态、骨发育和细胞应激反应中发挥重要作用。研究表明,DDRGK1突变可导致Shohat型脊柱干骺端发育不良(SEMD),这是一种罕见的常染色体隐性遗传病,表现为脊柱和干骺端发育异常。此外,DDRGK1可能参与癌症等疾病的发生发展,但具体机制尚在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Shohat型脊柱干骺端发育不良 DDRGK1基因突变导致Ufm1修饰系统功能异常,影响内质网稳态和骨发育,致病机制明确。 已明确致病
癌症 DDRGK1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响内质网应激和细胞增殖参与肿瘤发生,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.433C>T (p.Arg145*) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.682G>A (p.Gly228Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型突变):导致DDRGK1蛋白功能缺失或显著降低,是Shohat型脊柱干骺端发育不良的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明DDRGK1存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明DDRGK1存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0006629 (lipid metabolic process) • GO:0006915 (apoptotic process)
• GO:0007165 (signal transduction)

相关通路

Ufm1 conjugation pathway (Ufm1 cascade)
Unfolded protein response (UPR)

蛋白质功能简介

DDRGK1蛋白含有DDRGK结构域,是Ufm1修饰系统的关键底物。它定位于内质网,参与Ufm1修饰过程,调节内质网稳态和应激反应。DDRGK1在骨发育中发挥重要作用,其突变导致Shohat型脊柱干骺端发育不良。此外,DDRGK1可能通过影响细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生,但具体机制尚需进一步研究。

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