DDX18基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
DDX18编码ATP依赖性RNA解旋酶,参与核糖体生物发生和细胞增殖,与多种肿瘤发生发展相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DDX18 |
|---|---|
| 基因全名 | DEAD-box helicase 18 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q33.1 |
| NCBI Gene ID | 8886 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8886 |
| Ensembl ID | ENSG00000188243 |
| UniProt ID | Q9NVP1 |
| OMIM ID | 604312 |
| HGNC ID | 2740 |
| 基因别名 | DBP5, HAS1, HEL54 |
基因功能与研究简介
DDX18基因编码DEAD-box RNA解旋酶家族成员,该蛋白参与核糖体RNA加工和核糖体生物发生,在细胞增殖和生长中发挥重要作用。研究表明DDX18在多种肿瘤中高表达,可能通过调控核糖体合成促进肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | DDX18在肝细胞癌中高表达,可能通过促进核糖体生物发生和细胞增殖参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | DDX18在结直肠癌中表达上调,与不良预后相关,可能作为癌基因发挥作用。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | DDX18在乳腺癌中高表达,可能通过调控细胞周期和增殖促进肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | DDX18在非小细胞肺癌中表达升高,可能参与肿瘤侵袭和转移。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但临床意义未明 |
| c.567C>T (p.Arg189Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但临床意义未明 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明DDX18突变导致功能缺失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明DDX18突变导致功能获得。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明DDX18突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003724 RNA helicase activity | • GO:0005524 ATP binding |
| • GO:0006364 rRNA processing | • GO:0005730 nucleolus |
| • GO:0042254 ribosome biogenesis |
相关通路
• Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
• rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)
蛋白质功能简介
DDX18蛋白属于DEAD-box RNA解旋酶家族,含有保守的DEAD-box结构域,具有ATP依赖的RNA解旋酶活性。该蛋白主要定位于核仁,参与核糖体RNA前体的加工和核糖体亚基的组装。DDX18在细胞增殖中起重要作用,其表达水平与细胞周期进程相关。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|