DDX23基因|RNA剪接调控、疾病关联与突变研究

DDX23是U5 snRNP复合物的核心RNA解旋酶,在pre-mRNA剪接中发挥关键作用,其突变与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 DDX23
基因全名 DEAD-box helicase 23
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q13.12
NCBI Gene ID 9416 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9416
Ensembl ID ENSG00000174238
UniProt ID Q9BUQ8
OMIM ID 612172
HGNC ID 17367
基因别名 PRP28, U5-100K

基因功能与研究简介

DDX23基因编码DEAD-box RNA解旋酶家族成员,是U5小核核糖核蛋白(snRNP)复合物的核心组分,在pre-mRNA剪接中催化RNA构象变化,促进剪接体组装和催化。DDX23在多种组织中表达,参与细胞增殖、凋亡和应激反应。其突变或表达异常与神经发育障碍、癌症等疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 DDX23突变可能导致剪接异常,影响神经发育相关基因的表达,但具体机制尚不明确。 ClinVar中有致病性变异报道,但证据有限。
癌症 DDX23在多种癌症中表达上调,可能通过调控剪接促进肿瘤发生发展,但具体机制仍在研究中。 COSMIC数据库记录有体细胞突变,但频率较低。
视网膜色素变性 有研究提示DDX23突变与视网膜色素变性相关,但证据尚不充分。 OMIM中提及,但未明确致病。

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性髓系白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确。
c.2345C>T (p.Arg782Trp) 错义突变 罕见 ClinVar报道为意义不明确。
c.3456del (p.Glu1152LysfsTer3) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致DDX23蛋白活性降低或缺失,影响剪接过程,但具体证据有限。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明DDX23存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明DDX23突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003724 RNA helicase activity • GO:0005681 spliceosomal complex
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0008380 RNA splicing
• GO:0005524 ATP binding

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

DDX23蛋白属于DEAD-box RNA解旋酶家族,包含保守的DEAD-box结构域,具有ATP依赖的RNA解旋酶活性。作为U5 snRNP的核心组分,DDX23在剪接体B*复合物中发挥作用,促进pre-mRNA剪接的催化步骤。DDX23还参与DNA损伤反应和细胞周期调控。

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