DDX27基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱

DDX27编码DEAD-box RNA解旋酶,参与核糖体生物发生和细胞增殖,与结直肠癌等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 DDX27
基因全名 DEAD-box helicase 27
基因类型 protein-coding
染色体位置 20q13.13
NCBI Gene ID 55661 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55661
Ensembl ID ENSG00000124228
UniProt ID Q96GQ7
OMIM ID 616582
HGNC ID 20170
基因别名 DEAD-box protein 27; DEAD box protein 27; DKFZp434B041; FLJ14332; MGC111024

基因功能与研究简介

DDX27基因编码DEAD-box RNA解旋酶家族成员,该蛋白含有保守的DEAD-box基序,具有ATP依赖的RNA解旋酶活性。DDX27主要定位于核仁,参与核糖体RNA加工和核糖体生物发生,对细胞增殖和生长至关重要。研究表明DDX27在多种癌症中高表达,可能通过促进核糖体合成来支持肿瘤细胞增殖。此外,DDX27还参与其他RNA代谢过程,如mRNA剪接和翻译调控。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 DDX27在结直肠癌组织中高表达,可能通过促进核糖体生物发生和细胞增殖来促进肿瘤发生发展。 较强研究证据
肝细胞癌 DDX27在肝细胞癌中表达上调,与不良预后相关,可能作为癌基因发挥作用。 较强研究证据
乳腺癌 DDX27在乳腺癌中高表达,可能通过调控细胞周期和增殖影响肿瘤进展。 潜在关联
胃癌 DDX27在胃癌中表达升高,可能参与肿瘤细胞增殖和转移。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
AGS 暂无可靠数据 胃癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456C>T (p.Ser152Leu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性或活性
c.789del (p.Glu264fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致DDX27蛋白活性降低或缺失,可能影响核糖体生物发生,导致细胞增殖异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强DDX27的RNA解旋酶活性或表达,可能促进细胞过度增殖,与肿瘤发生相关。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型DDX27的功能,影响核糖体组装,导致细胞生长抑制。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003724 RNA helicase activity • GO:0005524 ATP binding
• GO:0005730 nucleolus • GO:0006364 rRNA processing
• GO:0042254 ribosome biogenesis • GO:0005634 nucleus

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

DDX27蛋白属于DEAD-box RNA解旋酶家族,含有保守的DEXDc和HELICc结构域。该蛋白主要定位于核仁,参与核糖体RNA前体的加工和核糖体亚基的组装。DDX27通过其ATP酶和解旋酶活性,促进rRNA的折叠和加工,从而调控核糖体生物发生。此外,DDX27还可能参与mRNA的剪接和翻译调控。在细胞增殖活跃的组织和肿瘤细胞中,DDX27表达上调,提示其在细胞生长和增殖中发挥重要作用。

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