DDX47基因|RNA解旋酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

DDX47编码DEAD-box RNA解旋酶,参与核糖体生物发生和RNA代谢,与多种癌症及发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 DDX47
基因全名 DEAD-box helicase 47
基因类型 protein-coding
染色体位置 12p13.1
NCBI Gene ID 51202 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51202
Ensembl ID ENSG00000111331
UniProt ID Q9H0S4
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID 20072
基因别名 EIF4A3-like, MGC2594, RP11-145E5.3

基因功能与研究简介

DDX47基因编码DEAD-box RNA解旋酶家族成员,该蛋白在核糖体生物发生、pre-mRNA剪接和RNA代谢中发挥重要作用。研究表明DDX47参与细胞增殖和凋亡调控,其异常表达与多种肿瘤的发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 DDX47在肝细胞癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 较强研究证据
结直肠癌 DDX47在结直肠癌组织中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控Wnt/β-catenin通路促进肿瘤进展。 较强研究证据
肺癌 DDX47在非小细胞肺癌中表达升高,可能通过影响细胞周期和凋亡促进肿瘤生长。 潜在关联
乳腺癌 DDX47在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤侵袭和转移。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性或功能
c.567C>T (p.Arg189Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响RNA结合能力
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致DDX47蛋白活性降低,影响核糖体生物发生和RNA代谢,进而导致细胞增殖异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强DDX47的RNA解旋酶活性,促进细胞过度增殖,与肿瘤发生相关。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常DDX47蛋白的功能,导致RNA代谢紊乱,影响细胞稳态。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003724 RNA helicase activity • GO:0005524 ATP binding
• GO:0006364 rRNA processing • GO:0006397 mRNA processing
• GO:0005634 nucleus

相关通路

Ribosome biogenesis
Spliceosome pathway

蛋白质功能简介

DDX47蛋白属于DEAD-box RNA解旋酶家族,含有保守的DEAD-box结构域,具有ATP依赖的RNA解旋酶活性。该蛋白主要定位于细胞核,参与核糖体RNA加工和pre-mRNA剪接。DDX47通过调控RNA代谢影响细胞增殖和凋亡,其异常表达与多种癌症相关。

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