DDX49基因|RNA解旋酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

DDX49是一种DEAD-box RNA解旋酶,参与RNA代谢和核糖体生物发生,与多种癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 DDX49
基因全名 DEAD-box helicase 49
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.2
NCBI Gene ID 54555 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54555
Ensembl ID ENSG00000105639
UniProt ID Q9Y2V3
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:20095
基因别名 DBP8

基因功能与研究简介

DDX49(DEAD-box helicase 49)编码DEAD-box RNA解旋酶家族成员,该家族蛋白参与RNA代谢的多个方面,包括转录、剪接、翻译和核糖体生物发生。DDX49在细胞核和细胞质中均有定位,可能参与核糖体RNA加工和细胞增殖调控。研究表明DDX49在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 DDX49在肝细胞癌中表达下调,可能通过影响细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 较强研究证据
结直肠癌 DDX49在结直肠癌中表达上调,可能促进肿瘤进展,但证据有限。 潜在关联
神经发育异常 DDX49突变与神经发育异常相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝细胞癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但证据不足
c.456C>T (p.Ser152Leu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但证据不足
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致DDX49蛋白活性降低或丧失,影响RNA代谢和细胞增殖,与肿瘤发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强DDX49的促癌活性,但目前在DDX49中尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常DDX49功能,但目前在DDX49中尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003724 RNA helicase activity • GO:0005524 ATP binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0006364 rRNA processing • GO:0008283 cell proliferation

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
RNA processing (Reactome: R-HSA-8953854)

蛋白质功能简介

DDX49蛋白属于DEAD-box RNA解旋酶家族,具有保守的Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD)基序,依赖ATP水解提供能量来解开RNA双链或重塑RNA-蛋白质复合物。该蛋白可能参与核糖体RNA前体的加工和核糖体组装,从而影响蛋白质合成和细胞生长。在多种癌症中表达异常,提示其可能作为潜在的治疗靶点。

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