DENND1C基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

DENND1C编码DENN结构域蛋白,作为Rab35的鸟嘌呤核苷酸交换因子,参与膜运输和细胞信号调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 DENND1C
基因全名 DENN domain containing 1C
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 79958 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79958
Ensembl ID ENSG00000105755
UniProt ID Q8TEX9
OMIM ID 613292
HGNC ID 28343
基因别名 DENND1C, FAM31C, dJ1158J13.2

基因功能与研究简介

DENND1C(DENN domain containing 1C)编码一个含有DENN结构域的蛋白质,属于DENND1家族。该蛋白作为Rab35的鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),激活Rab35,从而调控内体运输、细胞迁移和信号转导。DENND1C在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,DENND1C可能参与神经发育、免疫应答和肿瘤发生等过程。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 DENND1C可能通过调控Rab35影响肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭,但具体机制尚不明确。 潜在关联
神经系统疾病 DENND1C在脑组织中高表达,可能参与神经元内体运输,与神经发育和神经退行性疾病相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序)
睾丸 暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序)
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Ile412Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但无明确致病性证据
c.567C>T (p.Pro189Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,但无明确致病性证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明DENND1C的突变导致功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明DENND1C的突变导致功能获得。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明DENND1C的突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005768 (endosome) • GO:0005794 (Golgi apparatus)
• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0016020 (membrane)
• GO:0032456 (endocytic recycling) • GO:0043547 (positive regulation of GTPase activity)

相关通路

Rab35 signaling pathway
Endocytosis
Vesicle-mediated transport

蛋白质功能简介

DENND1C蛋白包含一个DENN结构域,该结构域负责与Rab35结合并催化GDP/GTP交换,从而激活Rab35。Rab35参与内体运输、细胞迁移和细胞分裂等过程。DENND1C还包含一个C端卷曲螺旋结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。

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