DESI2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
DESI2编码去SUMO化酶,参与蛋白质稳态调控,与肿瘤发生和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DESI2 |
|---|---|
| 基因全名 | desumoylating isopeptidase 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q42.13 |
| NCBI Gene ID | 51029 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51029 |
| Ensembl ID | ENSG00000117525 |
| UniProt ID | Q9H6Z9 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:29372 |
| 基因别名 | FLJ13910, PPPDE2, C1orf131 |
基因功能与研究简介
DESI2(desumoylating isopeptidase 2)编码一种去SUMO化酶,属于DESI家族,能够去除靶蛋白上的SUMO修饰,从而调节蛋白质的稳定性、定位和功能。DESI2参与多种细胞过程,包括DNA损伤修复、细胞周期调控和凋亡。研究表明,DESI2在多种肿瘤中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子,具体作用取决于细胞环境。此外,DESI2还可能与神经退行性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | DESI2在结直肠癌中表达下调,可能通过影响β-catenin信号通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | DESI2在肝癌中表达降低,与不良预后相关,可能通过调控p53稳定性影响肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 神经退行性疾病 | DESI2可能参与tau蛋白的SUMO化调控,与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.457C>T (p.Arg153Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1042A>G (p.Thr348Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):导致DESI2蛋白功能丧失或减弱,可能影响去SUMO化活性,进而影响下游信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明DESI2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明DESI2存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0016929 (SUMO-specific protease activity) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
相关通路
• SUMOylation pathway (Reactome: R-HSA-2990846)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
蛋白质功能简介
DESI2蛋白属于肽酶C97家族,包含一个保守的催化结构域,能够特异性去除底物蛋白上的SUMO修饰。DESI2在细胞核和细胞质中均有分布,参与调控多种底物的SUMO化状态,从而影响其功能。研究表明,DESI2可能通过去SUMO化p53、β-catenin等关键蛋白,参与肿瘤发生和神经退行性疾病的调控。