DGCR8基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
DGCR8是microRNA加工复合物的关键亚基,参与多种生理和病理过程,其突变与DiGeorge综合征及神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DGCR8 |
|---|---|
| 基因全名 | DGCR8 microprocessor complex subunit |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q11.21 |
| NCBI Gene ID | 54487 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54487 |
| Ensembl ID | ENSG00000127418 |
| UniProt ID | Q8WYQ5 |
| OMIM ID | 609030 |
| HGNC ID | 2847 |
| 基因别名 | C22orf12, DGCRK6, pasha |
基因功能与研究简介
DGCR8(DiGeorge syndrome critical region gene 8)是microRNA加工复合物(Microprocessor complex)的关键亚基,与DROSHA共同作用,将pri-miRNA加工为pre-miRNA,是miRNA生物发生的关键步骤。DGCR8还参与其他RNA加工过程,如rRNA加工和mRNA剪接。DGCR8基因位于22q11.2区域,该区域的缺失与DiGeorge综合征(22q11.2缺失综合征)相关。DGCR8功能异常与多种疾病相关,包括神经发育障碍、精神分裂症、癌症等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| DiGeorge综合征 | 22q11.2区域缺失导致DGCR8单倍剂量不足,影响miRNA加工,导致神经嵴发育异常,引起心脏畸形、免疫缺陷、面部异常等。 | 已明确致病 |
| 精神分裂症 | DGCR8单倍剂量不足可能影响miRNA表达,导致神经元发育和突触功能异常,增加精神分裂症风险。 | 具有较强研究证据 |
| 自闭症谱系障碍 | DGCR8突变或表达异常可能影响miRNA加工,与自闭症相关。 | 潜在关联 |
| 癌症 | DGCR8在多种癌症中表达异常,可能通过影响miRNA加工促进肿瘤发生发展。 | 癌症相关 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1364A>G (p.Tyr455Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1672C>T (p.Arg558Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| 22q11.2缺失 | 拷贝数变异 | 常见 | 单倍剂量不足,导致功能缺失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
DGCR8功能缺失突变或单倍剂量不足导致microRNA加工受损,影响下游基因表达,与DiGeorge综合征和神经发育障碍相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明DGCR8存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明DGCR8存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0004525 ribonuclease III activity |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0010467 gene expression | • GO:0031053 primary miRNA processing |
| • GO:0070878 miRNA metabolic process |
相关通路
• MicroRNA biogenesis (Reactome: R-HSA-203927)
• Gene silencing by RNA (Reactome: R-HSA-74160)
蛋白质功能简介
DGCR8蛋白是microprocessor复合物的RNA结合亚基,与DROSHA核酸酶结合,识别pri-miRNA并协助切割产生pre-miRNA。DGCR8包含两个双链RNA结合结构域(dsRBD)和一个富含脯氨酸的区域,其C端区域与DROSHA相互作用。DGCR8还参与其他RNA加工过程,如rRNA加工和mRNA剪接。DGCR8蛋白在细胞核中发挥主要功能,但也可在细胞质中检测到。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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