DMRTA2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
DMRTA2(Doublesex- and mab-3-related transcription factor A2)是调控神经发育和性别决定的关键转录因子,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DMRTA2 |
|---|---|
| 基因全名 | Doublesex- and mab-3-related transcription factor A2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p31.1 |
| NCBI Gene ID | 63950 ncbi.nlm.nih.gov/gene/63950 |
| Ensembl ID | ENSG00000142733 |
| UniProt ID | Q9Y5R6 |
| OMIM ID | 610350 |
| HGNC ID | 1390 |
| 基因别名 | DMRT5 |
基因功能与研究简介
DMRTA2(也称为DMRT5)是DMRT基因家族的成员,编码一个含有DM结构域的转录因子。该基因在神经发育中发挥关键作用,特别是在大脑皮层发育过程中调控神经元的产生和分化。此外,DMRTA2也参与性别决定和性腺发育。研究表明,DMRTA2的突变与神经发育障碍(如智力障碍和癫痫)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | DMRTA2突变可能导致神经元迁移和分化异常,影响大脑皮层发育,与智力障碍和癫痫相关。 | ClinVar, OMIM |
| 性别发育异常 | DMRTA2在性腺发育中起作用,突变可能影响性别决定,但证据有限。 | OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 大脑皮层 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 神经干细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 神经元 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸支持细胞 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.200A>G (p.Tyr67Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变导致截短蛋白,可能被无义介导的mRNA降解(NMD)清除,或产生无功能蛋白,导致单倍剂量不足。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明DMRTA2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明DMRTA2突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 (DNA binding) | • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006355 (regulation of transcription |
| • DNA-templated) | • GO:0021537 (telencephalon development) |
| • GO:0030154 (cell differentiation) |
相关通路
• Notch signaling pathway (WP268)
• Neural crest differentiation (WP2064)
蛋白质功能简介
DMRTA2蛋白包含一个DM结构域,该结构域介导DNA结合。作为转录因子,DMRTA2调控下游基因的表达,参与神经前体细胞的增殖和分化。在发育过程中,DMRTA2的表达水平受到严格调控,其失调可能导致神经发育异常。