DNER基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
DNER(Delta/Notch样EGF重复序列)是一种跨膜蛋白,在神经发育和突触可塑性中发挥关键作用,其异常表达与多种神经系统疾病和肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DNER |
|---|---|
| 基因全名 | Delta/Notch-like EGF repeat containing |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q36.3 |
| NCBI Gene ID | 92737 ncbi.nlm.nih.gov/gene/92737 |
| Ensembl ID | ENSG00000168961 |
| UniProt ID | Q8NFT8 |
| OMIM ID | 607479 |
| HGNC ID | 24456 |
| 基因别名 | bet, UNQ26, FLJ16341, MGC4618 |
基因功能与研究简介
DNER基因编码一种I型跨膜蛋白,属于EGF重复序列家族。该蛋白在神经系统中高表达,尤其在神经元和胶质细胞中,参与Notch信号通路的调控,影响神经干细胞的分化、神经元成熟和突触可塑性。DNER还通过其胞外域与Notch受体相互作用,调节细胞命运决定。此外,DNER在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生和进展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | 潜在关联:DNER表达水平在精神分裂症患者前额叶皮层中降低,可能影响突触功能。 | 研究证据:多项病例对照研究显示DNER表达下调,但尚未明确致病。PMID: 25664813 |
| 阿尔茨海默病 | 潜在关联:DNER在阿尔茨海默病患者脑中表达改变,可能参与神经退行性过程。 | 研究证据:表达谱研究显示DNER在AD患者海马中表达异常,但机制未明。PMID: 28472499 |
| 胶质瘤 | 癌症相关:DNER在胶质瘤中表达上调,可能促进肿瘤细胞增殖和侵袭。 | 研究证据:免疫组化和表达分析显示DNER高表达与胶质瘤恶性程度相关。PMID: 29187742 |
| 肝细胞癌 | 癌症相关:DNER在肝细胞癌中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。 | 研究证据:临床样本分析显示DNER低表达与预后不良相关。PMID: 30150772 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于RNA测序和免疫组化) |
| 小脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 海马 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系,DNER表达较高 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系,DNER表达较高 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系,DNER表达较低 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs112735431 | SNV | 0.01% | 位于3'UTR,可能影响miRNA结合,功能影响未知 |
| c.1234A>G (p.I412V) | 错义突变 | 罕见 | 位于EGF样结构域,可能影响蛋白折叠或配体结合,功能影响待验证 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007399 (nervous system development) | • GO:0007268 (chemical synaptic transmission) |
| • GO:0007219 (Notch signaling pathway) |
相关通路
• Notch signaling pathway (KEGG: hsa04330)
• Axon guidance (KEGG: hsa04360)
蛋白质功能简介
DNER蛋白是一种I型跨膜蛋白,包含多个EGF样重复序列和一个胞内域。其胞外域可与Notch受体结合,调节Notch信号通路。在神经系统中,DNER促进神经元分化、突触形成和可塑性。在肿瘤中,DNER的作用具有组织特异性:在胶质瘤中可能作为癌基因,而在肝癌中可能作为抑癌基因。