DNMT3L基因|基因功能、疾病关联、突变与表观遗传研究

DNMT3L是DNA甲基转移酶3样蛋白,作为调控因子参与基因组印记和生殖细胞发育,其突变与多种遗传性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 DNMT3L
基因全名 DNA methyltransferase 3 like
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 21q22.3
NCBI Gene ID 29947 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29947
Ensembl ID ENSG00000142156
UniProt ID Q9UJW3
OMIM ID 606588
HGNC ID 2980
基因别名 DNMT3L, MGC10986

基因功能与研究简介

DNMT3L(DNA methyltransferase 3 like)基因编码一种与DNA甲基转移酶3A和3B相互作用的蛋白,但缺乏催化活性。DNMT3L在生殖细胞发育中至关重要,通过招募和刺激DNMT3A/3B的活性,建立基因组印记和重复序列的甲基化。该基因的突变与多种疾病相关,包括印记障碍和男性不育。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
低甲基化综合征 DNMT3L突变导致基因组印记异常,引起低甲基化综合征,表现为智力障碍、发育迟缓等。 ClinVar
男性不育 DNMT3L突变影响精子发生,导致无精子症或严重少精子症。 OMIM
癌症 DNMT3L异常表达与多种癌症相关,可能通过影响DNA甲基化促进肿瘤发生。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
卵巢 暂无可靠数据 高表达
胚胎干细胞 暂无可靠数据 高表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
NTERA-2 暂无可靠数据 胚胎癌细胞系
H1 hESC 暂无可靠数据 人胚胎干细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.112C>T (p.Arg38Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.278G>A (p.Arg93His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.463C>T (p.Arg155Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,丧失功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006306 DNA methylation
• GO:0007283 spermatogenesis • GO:0008584 male gonad development

相关通路

DNA methylation pathway
Genomic imprinting pathway

蛋白质功能简介

DNMT3L蛋白是DNA甲基转移酶3A和3B的辅因子,缺乏催化活性,但通过其N端结构域与DNMT3A/3B相互作用,增强其甲基转移酶活性。在生殖细胞中,DNMT3L对于建立亲本特异性甲基化印记至关重要。该蛋白在体细胞中表达较低,但在胚胎干细胞和生殖细胞中高表达。

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