DNMT3L基因|基因功能、疾病关联、突变与表观遗传研究
DNMT3L是DNA甲基转移酶3样蛋白,作为调控因子参与基因组印记和生殖细胞发育,其突变与多种遗传性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DNMT3L |
|---|---|
| 基因全名 | DNA methyltransferase 3 like |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 21q22.3 |
| NCBI Gene ID | 29947 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29947 |
| Ensembl ID | ENSG00000142156 |
| UniProt ID | Q9UJW3 |
| OMIM ID | 606588 |
| HGNC ID | 2980 |
| 基因别名 | DNMT3L, MGC10986 |
基因功能与研究简介
DNMT3L(DNA methyltransferase 3 like)基因编码一种与DNA甲基转移酶3A和3B相互作用的蛋白,但缺乏催化活性。DNMT3L在生殖细胞发育中至关重要,通过招募和刺激DNMT3A/3B的活性,建立基因组印记和重复序列的甲基化。该基因的突变与多种疾病相关,包括印记障碍和男性不育。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 低甲基化综合征 | DNMT3L突变导致基因组印记异常,引起低甲基化综合征,表现为智力障碍、发育迟缓等。 | ClinVar |
| 男性不育 | DNMT3L突变影响精子发生,导致无精子症或严重少精子症。 | OMIM |
| 癌症 | DNMT3L异常表达与多种癌症相关,可能通过影响DNA甲基化促进肿瘤发生。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胚胎干细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| NTERA-2 | 暂无可靠数据 | 胚胎癌细胞系 |
| H1 hESC | 暂无可靠数据 | 人胚胎干细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.112C>T (p.Arg38Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.278G>A (p.Arg93His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.463C>T (p.Arg155Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,丧失功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006306 DNA methylation |
| • GO:0007283 spermatogenesis | • GO:0008584 male gonad development |
相关通路
• DNA methylation pathway
• Genomic imprinting pathway
蛋白质功能简介
DNMT3L蛋白是DNA甲基转移酶3A和3B的辅因子,缺乏催化活性,但通过其N端结构域与DNMT3A/3B相互作用,增强其甲基转移酶活性。在生殖细胞中,DNMT3L对于建立亲本特异性甲基化印记至关重要。该蛋白在体细胞中表达较低,但在胚胎干细胞和生殖细胞中高表达。