DROSHA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
DROSHA是microRNA加工过程中的关键核糖核酸酶,其功能异常与多种癌症及发育性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | DROSHA |
|---|---|
| 基因全名 | drosha ribonuclease III |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5p13.3 |
| NCBI Gene ID | 29102 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29102 |
| Ensembl ID | ENSG00000113360 |
| UniProt ID | Q9NRR4 |
| OMIM ID | 608828 |
| HGNC ID | 17902 |
| 基因别名 | RNASE3L, RNASEN, ETOHI2 |
基因功能与研究简介
DROSHA基因编码一种核糖核酸酶III酶,是microRNA(miRNA)生物合成途径中的关键酶。DROSHA在细胞核内将初级miRNA(pri-miRNA)加工为前体miRNA(pre-miRNA),随后由DICER1进一步加工成熟。DROSHA还参与核糖体RNA(rRNA)的加工和基因表达的调控。DROSHA功能异常与多种癌症(如Wilms肿瘤、白血病)和发育性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Wilms肿瘤 | DROSHA体细胞突变导致miRNA加工异常,影响细胞分化,促进肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 白血病 | DROSHA突变与急性髓系白血病(AML)相关,影响造血干细胞分化。 | 具有较强研究证据 |
| 肝癌 | DROSHA表达异常与肝细胞癌的发生发展相关。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | DROSHA突变或表达改变可能参与结直肠癌的进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾上腺 | 12.3 | 中等 |
| 骨髓 | 8.5 | 低 |
| 大脑 | 15.2 | 中等 |
| 乳腺 | 10.1 | 中等 |
| 结肠 | 9.8 | 低 |
| 肾脏 | 11.4 | 中等 |
| 肝脏 | 13.6 | 中等 |
| 肺 | 12.0 | 中等 |
| 卵巢 | 14.5 | 中等 |
| 胰腺 | 10.9 | 中等 |
| 前列腺 | 11.8 | 中等 |
| 皮肤 | 9.2 | 低 |
| 脾脏 | 7.8 | 低 |
| 胃 | 10.5 | 中等 |
| 睾丸 | 16.3 | 高 |
| 甲状腺 | 12.7 | 中等 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 18.5 | 人胚肾细胞系 |
| HeLa | 15.2 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 12.8 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 14.1 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 13.4 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.4045G>A (p.Asp1349Asn) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响DROSHA的催化活性,导致miRNA加工异常。 |
| c.511G>A (p.Gly171Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能丧失。 |
| c.1147C>T (p.Arg383Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失。 |
| c.3322_3323del (p.Glu1108fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
DROSHA突变导致蛋白功能丧失,影响miRNA加工,导致下游基因表达失调。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明DROSHA存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分突变可能产生显性负效应,干扰野生型DROSHA的功能。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004525 ribonuclease III activity | • GO:0006396 RNA processing |
| • GO:0031053 primary miRNA processing | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005730 nucleolus |
相关通路
• MicroRNA biogenesis (Reactome: R-HSA-203927)
• Gene silencing by RNA (Reactome: R-HSA-74160)
蛋白质功能简介
DROSHA蛋白由1374个氨基酸组成,包含两个RNase III结构域和一个dsRBD结构域。它作为核糖核酸酶III,在细胞核中切割pri-miRNA,释放约70核苷酸的pre-miRNA。DROSHA与DGCR8形成复合物,共同执行miRNA加工。此外,DROSHA还参与rRNA加工和DNA损伤应答。