E4F1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
E4F1是一种多功能转录因子,调控细胞周期、凋亡和DNA损伤应答,与多种癌症和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | E4F1 |
|---|---|
| 基因全名 | E4F transcription factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16p13.3 |
| NCBI Gene ID | 1877 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1877 |
| Ensembl ID | ENSG00000167972 |
| UniProt ID | Q66K89 |
| OMIM ID | 603023 |
| HGNC ID | 3256 |
| 基因别名 | E4F, RIE1, E4F-1 |
基因功能与研究简介
E4F1(E4F transcription factor 1)是一种多功能转录因子,属于GLI-Kruppel家族,参与调控细胞周期、凋亡、DNA损伤应答和代谢等关键生物学过程。E4F1通过结合特定的DNA序列(如E4F1结合位点)调节下游基因表达,并与p53、pRB等肿瘤抑制因子相互作用。研究表明,E4F1在多种癌症中表达异常,影响肿瘤的发生发展,同时也在胚胎发育和干细胞维持中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | E4F1在乳腺癌中高表达,可能通过调控细胞周期和凋亡促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | E4F1在肺癌中表达上调,与不良预后相关,可能参与肿瘤增殖和转移。 | 较强研究证据 |
| 肝癌 | E4F1在肝细胞癌中表达升高,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤生长。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | E4F1在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。 | 潜在关联 |
| 发育异常 | E4F1基因敲除小鼠表现出胚胎发育缺陷,提示其在发育中的关键作用。 | 动物模型证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567C>T (p.Arg189Trp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响DNA结合能力 |
| c.890_891insA (p.Leu297fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变:导致E4F1蛋白功能缺失或减弱,可能影响细胞周期调控和凋亡,与肿瘤发生相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强E4F1的转录激活或抑制功能,可能促进细胞增殖和肿瘤进展。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰野生型E4F1的功能,可能影响下游基因表达,导致细胞异常。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0007049 cell cycle |
| • GO:0006915 apoptotic process | • GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus |
相关通路
• p53 signaling pathway (hsa04115)
• Cell cycle (hsa04110)
• Apoptosis (hsa04210)
蛋白质功能简介
E4F1蛋白由E4F1基因编码,包含一个锌指结构域和一个BTB/POZ结构域,属于转录因子家族。E4F1在细胞核中发挥转录调控作用,通过与DNA结合调节靶基因表达。它参与调控细胞周期(如G1/S转换)、凋亡、DNA损伤应答等过程。E4F1与p53、pRB等肿瘤抑制因子相互作用,影响其稳定性或活性。在多种癌症中,E4F1表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡促进肿瘤发生发展。此外,E4F1在胚胎发育和干细胞维持中也具有重要作用。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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