EAF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

EAF1是ELL相关因子1,参与转录延伸调控,与RNA聚合酶II功能密切相关,在多种癌症中表达异常。

基因信息卡

基因符号 EAF1
基因全名 ELL associated factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p25.3
NCBI Gene ID 85403 ncbi.nlm.nih.gov/gene/85403
Ensembl ID ENSG00000114544
UniProt ID Q96C19
OMIM ID 609043
HGNC ID 20932
基因别名 ELL associated factor 1; FLJ10891; MGC129647

基因功能与研究简介

EAF1(ELL associated factor 1)是ELL复合物的一个亚基,参与RNA聚合酶II的转录延伸调控。EAF1通过与ELL蛋白相互作用,增强ELL的转录延伸活性,从而调节基因表达。EAF1在多种组织中表达,尤其在睾丸和骨髓中高表达。研究表明,EAF1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤的发生和发展。此外,EAF1还参与DNA损伤修复和细胞周期调控。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性髓系白血病 EAF1与ELL融合基因(MLL-ELL)相关,可能参与白血病发生。 较强研究证据
乳腺癌 EAF1在乳腺癌中表达上调,可能促进肿瘤增殖。 潜在关联
肺癌 EAF1在非小细胞肺癌中表达异常,可能影响预后。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.R152*) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能影响转录延伸调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006351 transcription • DNA-templated
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0005634 nucleus • GO:0005515 protein binding

相关通路

hsa03022 Basal transcription factors
hsa05202 Transcriptional misregulation in cancer

蛋白质功能简介

EAF1蛋白包含一个保守的EAF1结构域,参与蛋白-蛋白相互作用。EAF1与ELL蛋白结合,形成ELL-EAF1复合物,增强RNA聚合酶II的转录延伸活性。EAF1还参与DNA损伤修复,可能通过调节转录延伸来影响DNA损伤应答。

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