ECD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ECD(eccrine differentiation)基因编码一种参与细胞周期调控和蛋白质泛素化的蛋白,其异常表达与多种肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 ECD
基因全名 eccrine differentiation
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q22.1
NCBI Gene ID 11319 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11319
Ensembl ID ENSG00000119922
UniProt ID O15105
OMIM ID 606073
HGNC ID 3157
基因别名 GCR2, SGT1, HCA66

基因功能与研究简介

ECD基因编码一种含有TPR重复序列的蛋白,参与细胞周期调控、蛋白质泛素化以及DNA损伤应答。该蛋白与SKP1和CUL1相互作用,参与SCF E3泛素连接酶复合物的组装,从而调控多种底物的降解。ECD在多种组织中表达,其异常表达与肿瘤发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 ECD在乳腺癌中高表达,可能通过调控细胞周期促进肿瘤增殖。 较强研究证据
肺癌 ECD在肺癌组织中表达上调,与不良预后相关。 较强研究证据
结直肠癌 ECD在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤进展。 潜在关联
肝癌 ECD在肝细胞癌中表达升高,可能通过影响细胞周期促进肿瘤生长。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) SNV 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性
c.567C>T (p.Arg189Trp) SNV 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致蛋白功能丧失,影响细胞周期调控,但具体证据不足。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强蛋白活性,促进肿瘤发生,但具体证据不足。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常蛋白功能,但具体证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0007049 cell cycle • GO:0005634 nucleus

相关通路

hsa04120 Ubiquitin mediated proteolysis
hsa04110 Cell cycle

蛋白质功能简介

ECD蛋白含有TPR重复序列,参与SCF E3泛素连接酶复合物的组装,调控细胞周期相关蛋白的降解。该蛋白在多种肿瘤中高表达,可能通过促进细胞增殖参与肿瘤发生。

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