ECD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ECD(eccrine differentiation)基因编码一种参与细胞周期调控和蛋白质泛素化的蛋白,其异常表达与多种肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ECD |
|---|---|
| 基因全名 | eccrine differentiation |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q22.1 |
| NCBI Gene ID | 11319 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11319 |
| Ensembl ID | ENSG00000119922 |
| UniProt ID | O15105 |
| OMIM ID | 606073 |
| HGNC ID | 3157 |
| 基因别名 | GCR2, SGT1, HCA66 |
基因功能与研究简介
ECD基因编码一种含有TPR重复序列的蛋白,参与细胞周期调控、蛋白质泛素化以及DNA损伤应答。该蛋白与SKP1和CUL1相互作用,参与SCF E3泛素连接酶复合物的组装,从而调控多种底物的降解。ECD在多种组织中表达,其异常表达与肿瘤发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | ECD在乳腺癌中高表达,可能通过调控细胞周期促进肿瘤增殖。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | ECD在肺癌组织中表达上调,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | ECD在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 肝癌 | ECD在肝细胞癌中表达升高,可能通过影响细胞周期促进肿瘤生长。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.567C>T (p.Arg189Trp) | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致蛋白功能丧失,影响细胞周期调控,但具体证据不足。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变可能增强蛋白活性,促进肿瘤发生,但具体证据不足。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰正常蛋白功能,但具体证据不足。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0007049 cell cycle | • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• hsa04120 Ubiquitin mediated proteolysis
• hsa04110 Cell cycle
蛋白质功能简介
ECD蛋白含有TPR重复序列,参与SCF E3泛素连接酶复合物的组装,调控细胞周期相关蛋白的降解。该蛋白在多种肿瘤中高表达,可能通过促进细胞增殖参与肿瘤发生。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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