EED基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

EED是Polycomb抑制复合物2(PRC2)的核心组分,通过调控H3K27me3修饰参与基因沉默,其突变与Weaver综合征及多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 EED
基因全名 embryonic ectoderm development
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q14.2
NCBI Gene ID 8726 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8726
Ensembl ID ENSG00000074219
UniProt ID O75530
OMIM ID 605984
HGNC ID 3188
基因别名 WAIT1, COGIS

基因功能与研究简介

EED基因编码胚胎外胚层发育蛋白,是Polycomb抑制复合物2(PRC2)的核心亚基之一。PRC2通过催化组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化(H3K27me3)介导基因沉默,在发育、细胞分化和基因组稳定性中发挥关键作用。EED蛋白包含WD40重复结构域,负责识别H3K27me3标记,从而促进PRC2的招募和扩散。EED功能异常与Weaver综合征(一种过度生长综合征)以及多种癌症(如淋巴瘤、乳腺癌等)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Weaver综合征 EED功能缺失突变导致PRC2活性降低,H3K27me3水平下降,引起基因表达失调,导致过度生长和骨骼异常。 已明确致病(OMIM)
淋巴瘤 EED体细胞突变或表达异常可能通过影响PRC2功能促进肿瘤发生,但具体机制仍在研究中。 具有较强研究证据(COSMIC)
乳腺癌 EED高表达与不良预后相关,可能通过抑制肿瘤抑制基因表达促进肿瘤进展。 潜在关联(研究报道)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.Arg288His 错义突变 罕见 可能影响WD40结构域功能,导致PRC2活性降低
p.Arg288Cys 错义突变 罕见 可能影响WD40结构域功能,导致PRC2活性降低
p.Val425Met 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或相互作用
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

EED功能缺失突变导致PRC2活性降低,H3K27me3水平下降,引起基因表达失调,与Weaver综合征相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明EED存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能通过显性负效应干扰PRC2复合物组装,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0006325 chromatin organization
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0005634 nucleus • GO:0035098 histone H3-K27 methylation

相关通路

hsa04136 Autophagy - other
hsa05034 Alcoholism
hsa05200 Pathways in cancer

蛋白质功能简介

EED蛋白是PRC2复合物的核心成分,包含WD40重复结构域,能够识别H3K27me3标记,从而促进PRC2在基因组上的扩散和维持。EED通过调控基因沉默参与多种生物学过程,包括发育、细胞分化和基因组稳定性。其突变或表达异常与Weaver综合征和多种癌症相关。

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