EEFSEC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
EEFSEC基因编码硒代半胱氨酸tRNA特异性延伸因子,是硒蛋白合成过程中的关键调控因子,与硒蛋白相关疾病及癌症研究密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | EEFSEC |
|---|---|
| 基因全名 | eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q21.3 |
| NCBI Gene ID | 60678 ncbi.nlm.nih.gov/gene/60678 |
| Ensembl ID | ENSG00000132386 |
| UniProt ID | P57741 |
| OMIM ID | 607695 |
| HGNC ID | 24614 |
| 基因别名 | SELB, EFsec, eEFSec |
基因功能与研究简介
EEFSEC基因编码硒代半胱氨酸tRNA特异性延伸因子(eEFSec),该蛋白是硒蛋白合成途径中的关键因子,负责将硒代半胱氨酸-tRNA(Sec-tRNA[Ser]Sec)递送至核糖体,并参与硒代半胱氨酸掺入多肽链的过程。硒蛋白是重要的抗氧化酶和氧化还原调节因子,因此EEFSEC的功能对维持细胞氧化还原平衡至关重要。EEFSEC基因突变可能导致硒蛋白合成异常,进而影响多种生理过程,与某些疾病的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 硒蛋白缺乏相关疾病 | EEFSEC突变可能导致硒蛋白合成减少,影响抗氧化防御系统,增加氧化应激,与多种疾病相关。 | 暂无明确证据 |
| 癌症 | EEFSEC表达异常可能影响硒蛋白水平,进而影响细胞增殖、凋亡和氧化还原状态,与某些癌症的发生发展相关。 | 具有较强研究证据 |
| 神经退行性疾病 | 硒蛋白在神经系统中具有保护作用,EEFSEC功能异常可能增加神经退行性疾病风险。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1000A>G (p.Thr334Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.1500C>T (p.Arg500Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变:导致EEFSEC蛋白功能缺失或减弱,影响硒蛋白合成,可能引起硒蛋白缺乏相关疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明EEFSEC存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:目前暂无明确证据表明EEFSEC存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003746 (translation elongation factor activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0006414 (translational elongation) |
| • GO:0001516 (selenocysteine incorporation) |
相关通路
• hsa:ko00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis)
• hsa:ko03010 (Ribosome)
蛋白质功能简介
EEFSEC蛋白(eEFSec)是硒蛋白合成途径中的延伸因子,与Sec-tRNA[Ser]Sec和核糖体相互作用,促进硒代半胱氨酸掺入蛋白质。该蛋白包含GTP结合结构域和EF-Tu样结构域,通过GTP水解驱动翻译延伸。EEFSEC的表达水平影响硒蛋白的合成效率,进而调节细胞抗氧化能力。