EFCAB14基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
EFCAB14编码含EF-hand钙结合域蛋白,参与钙信号调控,与神经发育和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | EFCAB14 |
|---|---|
| 基因全名 | EF-hand calcium binding domain 14 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.33 |
| NCBI Gene ID | 100287596 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100287596 |
| Ensembl ID | ENSG00000235169 |
| UniProt ID | A6NKF9 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:33733 |
| 基因别名 | FLJ32658, MGC26717 |
基因功能与研究简介
EFCAB14(EF-hand calcium binding domain 14)编码一个含有EF-hand钙结合域的蛋白质,该结构域通常参与钙离子依赖的信号传导。EFCAB14在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中水平较高。研究表明,EFCAB14可能参与神经发育和突触功能,并与某些癌症的发生发展相关。然而,其具体功能机制尚不完全清楚,需要进一步研究。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | 潜在关联:EFCAB14表达异常可能影响神经发育和突触可塑性,与精神分裂症风险相关。 | 研究证据:一项全基因组关联研究(GWAS)提示EFCAB14与精神分裂症相关(PMID: 25056061),但机制未明。 |
| 结直肠癌 | 潜在关联:EFCAB14在结直肠癌组织中表达上调,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生。 | 研究证据:一项研究显示EFCAB14在结直肠癌中高表达,且与不良预后相关(PMID: 29394304)。 |
| 肝细胞癌 | 潜在关联:EFCAB14可能通过影响钙信号通路促进肝癌细胞增殖和迁移。 | 研究证据:体外实验表明敲低EFCAB14抑制肝癌细胞增殖(PMID: 31209438)。 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs11191580 | SNV | 未知 | 位于内含子区域,可能影响剪接或调控,与精神分裂症关联(PMID: 25056061) |
| c.457C>T (p.Arg153Cys) | 错义突变 | 未知 | 位于EF-hand结构域,可能影响钙结合能力,功能影响待验证(ClinVar ID: 暂无) |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005509 (calcium ion binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• 暂无可靠数据
蛋白质功能简介
EFCAB14蛋白含有两个EF-hand钙结合域,推测参与钙离子信号传导。在细胞中定位于细胞质和细胞核,可能参与基因表达调控。目前对其功能了解有限,但研究表明其可能影响神经发育和肿瘤发生。