EFL1基因|功能、疾病关联、突变与核糖体生物发生研究

EFL1(Elongation Factor Like GTPase 1)是核糖体60S亚基成熟的关键GTP酶,其突变与Shwachman-Diamond综合征样疾病相关。

基因信息卡

基因符号 EFL1
基因全名 Elongation Factor Like GTPase 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q25.2
NCBI Gene ID 79611 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79611
Ensembl ID ENSG00000137807
UniProt ID Q7Z2Z2
OMIM ID 617538
HGNC ID 25789
基因别名 EF1A-like GTPase, FLJ10895, KIAA0685

基因功能与研究简介

EFL1基因编码一种GTP结合蛋白,属于延伸因子样GTP酶家族。该蛋白参与核糖体60S亚基的成熟过程,与SBDS蛋白协同作用,促进eIF6从60S亚基释放,从而启动翻译。EFL1功能缺失会导致核糖体生物发生异常,进而影响蛋白质合成,与Shwachman-Diamond综合征样疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Shwachman-Diamond综合征样疾病 EFL1突变导致核糖体60S亚基成熟障碍,影响造血和骨骼发育,表现为胰腺外分泌功能不全、骨髓功能障碍和骨骼异常。 ClinVar, OMIM
急性髓系白血病(AML) EFL1突变可能增加AML风险,但证据有限,需进一步研究。 COSMIC, ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达(基于GTEx)
胰腺 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Trp) 错义突变 罕见 可能影响GTPase活性,导致功能丧失
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白折叠或功能
c.1567_1568del (p.Glu523fs) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

多数EFL1突变导致功能丧失,影响核糖体成熟。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005525 (GTP binding) • GO:0003924 (GTPase activity)
• GO:0042254 (ribosome biogenesis) • GO:0002181 (cytoplasmic translation)
• GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

Ribosome biogenesis (R-HSA-6791226)
Translation (R-HSA-72766)

蛋白质功能简介

EFL1蛋白是一种GTP酶,属于延伸因子样蛋白家族。它定位于细胞质,与SBDS蛋白形成复合物,在核糖体60S亚基成熟过程中催化eIF6的释放,从而促进80S核糖体形成并启动翻译。EFL1的GTPase活性对于其功能至关重要,突变可导致核糖体生物发生缺陷,进而引发疾病。

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