EFNA1基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱
EFNA1编码ephrin-A1,是Eph受体信号通路的关键配体,参与血管生成、神经发育及肿瘤发生。
基因信息卡
| 基因符号 | EFNA1 |
|---|---|
| 基因全名 | ephrin-A1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q21.3 |
| NCBI Gene ID | 1942 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1942 |
| Ensembl ID | ENSG00000169242 |
| UniProt ID | P20827 |
| OMIM ID | 601453 |
| HGNC ID | 3221 |
| 基因别名 | B61, EFL1, EPLG1, LERK1, TNFAIP4 |
基因功能与研究简介
EFNA1(ephrin-A1)是ephrin配体家族成员,属于糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白,通过与EphA受体(如EPHA2)结合介导细胞间信号传导。EFNA1在胚胎发育、血管生成、轴突导向和免疫调节中发挥重要作用。在多种肿瘤中,EFNA1表达异常,参与肿瘤血管生成、侵袭和转移。此外,EFNA1还参与炎症反应和组织修复。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | EFNA1在肝细胞癌中高表达,通过激活EPHA2促进肿瘤血管生成和侵袭,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | EFNA1在结直肠癌中表达上调,可能通过促进肿瘤细胞增殖和迁移参与肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | EFNA1在乳腺癌中表达升高,与肿瘤血管生成和转移相关。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | EFNA1在胃癌中表达上调,可能通过激活EphA受体促进肿瘤生长和转移。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | EFNA1在非小细胞肺癌中表达异常,可能参与肿瘤血管生成和侵袭。 | 潜在关联 |
| 糖尿病视网膜病变 | EFNA1参与视网膜血管生成,可能参与糖尿病视网膜病变的病理过程。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 人脐静脉内皮细胞,EFNA1表达与血管生成相关 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系,EFNA1表达可能参与肿瘤进展 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,EFNA1表达与肿瘤转移相关 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系,EFNA1表达可能参与肿瘤血管生成 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.456G>A (p.Trp152Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.789A>G (p.Ile263Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,可能丧失ephrin-A1功能,影响细胞间信号传导。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明EFNA1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明EFNA1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005102 (ephrin receptor binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007169 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway) | • GO:0001525 (angiogenesis) |
| • GO:0007399 (nervous system development) |
相关通路
• Ephrin-A signaling pathway (Reactome: R-HSA-3928662)
• Ephrin receptor signaling (KEGG: hsa04360)
蛋白质功能简介
EFNA1蛋白(ephrin-A1)由205个氨基酸组成,包含一个N端信号肽、一个ephrin配体结构域和一个C端GPI锚定序列。蛋白以GPI锚定形式表达于细胞表面,通过细胞间接触激活EphA受体,介导双向信号传导。EFNA1在胚胎发育中参与血管生成和轴突导向,在成体中参与组织稳态和免疫调节。在肿瘤中,EFNA1过表达促进血管生成和肿瘤侵袭。