EIF4A1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
EIF4A1是翻译起始因子复合物的核心RNA解旋酶,调控蛋白质合成,与多种癌症和发育疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | EIF4A1 |
|---|---|
| 基因全名 | eukaryotic translation initiation factor 4A1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17p13.1 |
| NCBI Gene ID | 1973 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1973 |
| Ensembl ID | ENSG00000161960 |
| UniProt ID | P60842 |
| OMIM ID | 602641 |
| HGNC ID | 3272 |
| 基因别名 | DDX2A, eIF-4A, eIF4A, eIF-4A-I |
基因功能与研究简介
EIF4A1基因编码真核翻译起始因子4A1(eIF4A1),是一种ATP依赖性RNA解旋酶,属于DEAD-box蛋白家族。eIF4A1是eIF4F复合物的核心组分,该复合物包括eIF4E(帽结合蛋白)和eIF4G(支架蛋白),负责将核糖体招募到mRNA的5'端帽结构,并解开mRNA 5'非翻译区的二级结构,从而促进翻译起始。EIF4A1在蛋白质合成中起关键作用,其表达和活性在多种癌症中上调,与肿瘤发生、发展和耐药性相关。此外,EIF4A1还参与细胞增殖、凋亡、应激反应等过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | EIF4A1在多种癌症中高表达,促进肿瘤细胞增殖、存活和转移。其通过调控翻译效率影响癌基因和抑癌基因的表达,与肿瘤发生发展密切相关。 | 较强研究证据 |
| 发育障碍 | EIF4A1基因突变可能导致智力障碍和生长发育异常,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
| 病毒感染 | EIF4A1参与病毒mRNA的翻译,某些病毒依赖eIF4A1进行复制,但具体疾病关联尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.100A>G (p.Thr34Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.200C>T (p.Pro67Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致eIF4A1蛋白活性降低或丧失,可能影响翻译起始,但目前在EIF4A1中尚无明确致病性功能缺失突变报道。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:导致eIF4A1活性增强,可能促进翻译和细胞增殖,与癌症相关,但具体突变尚未明确。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白可能干扰正常eIF4A1功能,但目前在EIF4A1中尚无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003724 RNA helicase activity | • GO:0003743 translation initiation factor activity |
| • GO:0005524 ATP binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0016281 eukaryotic translation initiation factor 4F complex | • GO:0006413 translational initiation |
相关通路
• hsa03013 RNA transport
• hsa04150 mTOR signaling pathway
• hsa05200 Pathways in cancer
蛋白质功能简介
eIF4A1蛋白由406个氨基酸组成,包含DEAD-box解旋酶特征性基序,具有ATP酶活性和RNA解旋酶活性。它作为eIF4F复合物的组成部分,在翻译起始过程中解开mRNA 5'端二级结构,促进核糖体扫描和起始密码子识别。eIF4A1的活性受多种翻译调控因子影响,如eIF4B、eIF4H和PDCD4。在癌症中,eIF4A1过表达或过度激活可促进肿瘤相关蛋白的合成,因此成为抗癌药物开发的潜在靶点。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|