ELF1基因|转录因子功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ELF1是ETS转录因子家族成员,调控免疫细胞发育与炎症反应,与自身免疫病和肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ELF1 |
|---|---|
| 基因全名 | E74-like factor 1 (ets domain transcription factor) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 13q13.3 |
| NCBI Gene ID | 1997 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1997 |
| Ensembl ID | ENSG00000120690 |
| UniProt ID | P32519 |
| OMIM ID | 189973 |
| HGNC ID | 3316 |
| 基因别名 | ELF-1, E74-like factor 1 |
基因功能与研究简介
ELF1(E74-like factor 1)是ETS转录因子家族成员,通过结合DNA上的ETS基序调控基因表达。在免疫系统中,ELF1参与T细胞和B细胞的发育、活化及细胞因子表达调控,并调节炎症反应相关基因。ELF1功能异常与自身免疫病(如系统性红斑狼疮)和某些肿瘤的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 系统性红斑狼疮 | ELF1表达或功能异常可能影响免疫调节,导致自身免疫反应 | 较强研究证据 |
| T细胞急性淋巴细胞白血病 | ELF1可能参与T细胞发育调控,异常表达与白血病发生相关 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | ELF1在肿瘤组织中的表达变化可能影响肿瘤进展 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Jurkat (T细胞白血病) | 暂无可靠数据 | T细胞系 |
| Raji (Burkitt淋巴瘤) | 暂无可靠数据 | B细胞系 |
| MCF7 (乳腺癌) | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs1128334 | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响ELF1表达或功能,与自身免疫病相关 |
| rs3765620 | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响ELF1结合位点,与炎症相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致ELF1蛋白功能丧失或减弱,可能影响免疫细胞发育和功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强ELF1活性,可能促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰正常ELF1功能,可能影响下游基因表达。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 (DNA binding) | • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006355 (regulation of transcription |
| • DNA-templated) | • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
相关通路
• hsa04660 (T cell receptor signaling pathway)
• hsa04662 (B cell receptor signaling pathway)
• hsa04064 (NF-kappa B signaling pathway)
蛋白质功能简介
ELF1蛋白属于ETS转录因子家族,包含ETS DNA结合域,能够识别并结合DNA上的ETS基序(GGAA/T)。ELF1在免疫细胞中高表达,调控多种免疫相关基因的转录,如细胞因子、趋化因子及其受体。ELF1还参与T细胞发育和活化,以及炎症反应的调节。
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