ELL基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ELL基因编码RNA聚合酶II延伸因子,参与转录延伸调控,与白血病及多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ELL |
|---|---|
| 基因全名 | elongation factor for RNA polymerase II |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19p13.1 |
| NCBI Gene ID | 8178 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8178 |
| Ensembl ID | ENSG00000105655 |
| UniProt ID | Q14241 |
| OMIM ID | 600284 |
| HGNC ID | 3331 |
| 基因别名 | ELL1, RNA polymerase II elongation factor ELL, ELL (eleven-nineteen lysine-rich leukemia gene) |
基因功能与研究简介
ELL基因编码RNA聚合酶II延伸因子,该蛋白通过直接与RNA聚合酶II相互作用,促进转录延伸过程中聚合酶的进程性,从而调控基因表达。ELL蛋白在细胞增殖、分化和凋亡等过程中发挥重要作用。ELL基因最初在急性髓系白血病(AML)中作为MLL的融合伙伴被发现,其融合蛋白MLL-ELL导致转录调控异常,促进白血病发生。此外,ELL基因的异常表达或突变也与多种实体瘤相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 急性髓系白血病 | MLL-ELL融合蛋白导致转录延伸异常,促进白血病发生 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | ELL基因表达上调与乳腺癌进展相关 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | ELL基因表达异常与结直肠癌预后相关 | 潜在关联 |
| 肺癌 | ELL基因拷贝数变异与肺癌发生相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| MLL-ELL融合 | 染色体易位 | 罕见 | 功能获得性突变,导致转录延伸异常,促进白血病 |
| ELL基因扩增 | 拷贝数变异 | 乳腺癌中约10% | 功能获得性突变,导致ELL过表达,促进肿瘤进展 |
| ELL基因缺失 | 拷贝数变异 | 肺癌中约5% | 功能缺失性突变,可能影响转录调控,促进肿瘤发生 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失性突变):导致ELL蛋白功能丧失或降低,可能影响转录延伸调控,与肿瘤发生相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得性突变):如MLL-ELL融合蛋白,获得新的转录调控功能,促进白血病发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):暂无明确证据表明ELL存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006351 transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006367 transcription initiation from RNA polymerase II promoter | • GO:0006368 transcription elongation from RNA polymerase II promoter |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• hsa03022 Basal transcription factors
• hsa05202 Transcriptional misregulation in cancer
蛋白质功能简介
ELL蛋白是RNA聚合酶II延伸因子,通过直接结合RNA聚合酶II,增强其延伸活性,促进转录延伸。ELL蛋白包含一个保守的ELL/NSL家族结构域,参与蛋白相互作用和转录调控。ELL蛋白在细胞核中定位,与多种转录调控因子相互作用,调控基因表达。ELL蛋白的异常表达或突变与白血病和实体瘤的发生发展密切相关。
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