ELL3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ELL3是RNA聚合酶II延伸因子,参与转录调控和DNA损伤修复,与多种癌症和发育过程相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ELL3 |
|---|---|
| 基因全名 | elongation factor for RNA polymerase II 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q15.3 |
| NCBI Gene ID | 80237 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80237 |
| Ensembl ID | ENSG00000137868 |
| UniProt ID | Q9HB65 |
| OMIM ID | 609608 |
| HGNC ID | 29316 |
| 基因别名 | ELONGIN-B, RNA polymerase II elongation factor ELL3 |
基因功能与研究简介
ELL3(elongation factor for RNA polymerase II 3)是ELL家族成员之一,编码一种转录延伸因子。该蛋白与RNA聚合酶II相互作用,促进转录延伸过程。ELL3还参与DNA损伤应答和细胞周期调控。研究表明,ELL3在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤发生和发展。此外,ELL3在胚胎发育和干细胞分化中也发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | ELL3在多种癌症中表达上调或下调,可能通过影响转录延伸和DNA修复参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 发育异常 | ELL3在小鼠胚胎发育中高表达,敲除导致胚胎致死,提示其在发育中的关键作用。 | 较强研究证据 |
| 暂无明确证据 | 暂无明确证据 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.456C>T (p.R152*) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.789delA (p.K263fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 导致移码,可能产生异常蛋白 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变可能导致蛋白截短或降解,从而丧失转录延伸功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明ELL3突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明ELL3突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006351 - transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006355 - regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006368 - transcription elongation from RNA polymerase II promoter | • GO:0005515 - protein binding |
| • GO:0005634 - nucleus |
相关通路
• hsa03022 - Basal transcription factors
• hsa03440 - Homologous recombination
蛋白质功能简介
ELL3蛋白属于ELL家族,包含一个保守的N端结构域和一个C端结构域。该蛋白与RNA聚合酶II的延伸复合物相互作用,促进转录延伸。ELL3还参与DNA损伤修复,可能通过调节同源重组修复途径。在细胞中,ELL3主要定位于细胞核,并在转录活跃区域富集。