ELP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ELP1基因编码Elongator复合物亚基1,参与tRNA修饰、转录延伸和神经发育,其突变与家族性自主神经功能障碍相关。

基因信息卡

基因符号 ELP1
基因全名 elongator complex protein 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q31.3
NCBI Gene ID 55178 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55178
Ensembl ID ENSG00000164949
UniProt ID Q9H2U9
OMIM ID 603722
HGNC ID 20632
基因别名 IKBKAP, IKI3, DYS

基因功能与研究简介

ELP1基因编码Elongator复合物的亚基1,该复合物在RNA聚合酶II转录延伸、tRNA修饰(尤其是U34位点的mcm5s2修饰)以及神经发育中发挥重要作用。ELP1突变(最常见为c.2204+6T>C剪接位点突变)导致家族性自主神经功能障碍(FD),一种常染色体隐性遗传病。ELP1还参与细胞骨架动力学、胞吐和DNA损伤应答等过程。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
家族性自主神经功能障碍 ELP1基因突变导致Elongator复合物功能缺陷,影响tRNA修饰和基因表达,进而导致自主神经系统发育异常。 已明确致病
癌症 ELP1在多种癌症中表达异常,可能通过影响tRNA修饰和基因表达参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
肾上腺 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2204+6T>C 剪接位点突变 常见于FD患者 导致外显子20跳跃,产生截短蛋白,功能丧失
p.Arg696Pro 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或功能,与FD相关
p.Val1029Phe 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与FD相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

ELP1突变导致功能丧失,如剪接位点突变导致截短蛋白,是FD的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明ELP1突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明ELP1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006400 tRNA modification
• GO:0005829 cytosol • GO:0005634 nucleus

相关通路

Elongator complex pathway
tRNA modification pathway

蛋白质功能简介

ELP1蛋白是Elongator复合物的核心亚基,该复合物由ELP1-ELP6组成。ELP1作为支架蛋白,参与复合物的组装和稳定性。Elongator复合物通过其组蛋白乙酰转移酶活性参与转录延伸,并通过催化tRNA U34位点的mcm5s2修饰影响翻译。ELP1在神经系统中高表达,对神经元发育和功能至关重要。

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