ELP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ELP3是Elongator复合物的催化亚基,参与tRNA修饰、转录延伸及神经发育,其突变与神经发育障碍和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ELP3 |
|---|---|
| 基因全名 | elongator acetyltransferase complex subunit 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8p21.1 |
| NCBI Gene ID | 55140 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55140 |
| Ensembl ID | ENSG00000105851 |
| UniProt ID | Q9H9T3 |
| OMIM ID | 612722 |
| HGNC ID | 20696 |
| 基因别名 | FLJ10422, DKFZp686K0520 |
基因功能与研究简介
ELP3基因编码Elongator复合物的催化亚基,该复合物参与多种细胞过程,包括tRNA修饰(尤其是5-甲氧羰基甲基-2-硫代尿苷的合成)、转录延伸、DNA损伤修复和神经元迁移。ELP3在神经系统中高表达,其功能缺失与神经发育障碍和神经退行性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肌萎缩侧索硬化 | ELP3基因突变可能导致运动神经元对氧化应激的易感性增加,影响tRNA修饰和蛋白稳态,从而参与ALS的发病机制。 | 较强研究证据 |
| 遗传性痉挛性截瘫 | ELP3突变可能影响轴突运输和神经元功能,导致皮质脊髓束变性,表现为痉挛性截瘫。 | 较强研究证据 |
| 神经发育障碍 | ELP3功能缺失可能影响神经元迁移和突触形成,与智力障碍和发育迟缓相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| p.Arg452Trp | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| p.Val548Met | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1712+1G>A | 剪接突变 | 罕见 | 可能导致剪接异常 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
ELP3突变导致蛋白功能丧失或降低,影响tRNA修饰和转录延伸,与神经发育障碍相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ELP3突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ELP3突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0008270 zinc ion binding |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006400 tRNA modification | • GO:0008033 tRNA processing |
| • GO:0009986 cell surface | • GO:0016740 transferase activity |
| • GO:0016746 acyltransferase activity | • GO:0030488 tRNA methylation |
| • GO:0032797 SMN complex | • GO:0043025 neuronal cell body |
| • GO:0045202 synapse | • GO:0046872 metal ion binding |
| • GO:0070062 extracellular exosome |
相关通路
• Elongator complex pathway
• tRNA modification pathway
蛋白质功能简介
ELP3蛋白是Elongator复合物的催化亚基,具有组蛋白乙酰转移酶活性,并参与tRNA的修饰,特别是合成5-甲氧羰基甲基-2-硫代尿苷(mcm5s2U)。该蛋白在神经系统中高表达,对神经元迁移和突触功能至关重要。ELP3功能缺失可导致tRNA修饰缺陷,影响蛋白翻译和细胞应激反应,与神经退行性疾病和神经发育障碍相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|