EP400基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

EP400是染色质重塑复合物的重要组分,参与DNA损伤修复和转录调控,与多种癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 EP400
基因全名 E1A binding protein p400
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q24.33
NCBI Gene ID 57634 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57634
Ensembl ID ENSG00000131844
UniProt ID Q96L91
OMIM ID 606265
HGNC ID 11919
基因别名 p400, E1A-binding protein p400, FLJ11088, KIAA1498

基因功能与研究简介

EP400基因编码一个ATP依赖性染色质重塑因子,属于SWI2/SNF2家族。该蛋白是NuA4组蛋白乙酰转移酶复合物的核心组分,参与DNA损伤修复、转录调控、细胞周期检查点控制以及染色质结构调节。EP400在多种组织中表达,尤其在睾丸和胸腺中高表达。研究表明EP400在肿瘤发生中具有双重作用,既可作为肿瘤抑制因子,也可促进肿瘤进展,具体取决于细胞环境和突变状态。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) EP400突变或表达异常与多种癌症相关,包括乳腺癌、肺癌、结直肠癌等。机制涉及DNA修复缺陷和转录失调。 较强研究证据
发育异常 EP400功能缺失可能导致胚胎发育异常,但具体人类疾病尚未明确。 潜在关联
神经发育障碍 有研究提示EP400突变可能与自闭症谱系障碍相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
胸腺 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.4567C>T (p.Arg1523Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,可能引起功能丧失
c.7890_7891insA (p.Gly2631ArgfsTer5) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致蛋白截短或降解,影响染色质重塑和DNA修复。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明EP400存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰正常复合物功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004386 • GO:0005515
• GO:0005634 • GO:0006338
• GO:0006281 • GO:0006351

相关通路

hsa03440
hsa04110
hsa05200

蛋白质功能简介

EP400蛋白是NuA4组蛋白乙酰转移酶复合物的核心ATP酶亚基,通过水解ATP提供能量,促进染色质重塑。该蛋白参与DNA双链断裂修复、转录调控和细胞周期检查点控制。EP400还与其他蛋白如TRRAP、EPC1等相互作用,形成多亚基复合物。其功能异常与基因组不稳定和肿瘤发生密切相关。

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