ERCC8基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ERCC8基因编码CSA蛋白,是转录偶联核苷酸切除修复(TC-NER)的关键因子,其突变导致Cockayne综合征A型,并与多种癌症风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ERCC8 |
|---|---|
| 基因全名 | ERCC8, CSA (Cockayne syndrome A) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q12.1 |
| NCBI Gene ID | 1161 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1161 |
| Ensembl ID | ENSG00000149136 |
| UniProt ID | Q13216 |
| OMIM ID | 609412 |
| HGNC ID | 3435 |
| 基因别名 | CSA, CKN1, UVSS2 |
基因功能与研究简介
ERCC8基因编码CSA蛋白,是转录偶联核苷酸切除修复(TC-NER)途径的核心成分。CSA蛋白与DDB1、CUL4A和RBX1形成E3泛素连接酶复合物,参与修复RNA聚合酶II停滞的DNA损伤。ERCC8突变导致Cockayne综合征A型(CSA),表现为生长障碍、神经系统退化和光敏感。此外,ERCC8多态性与某些癌症风险相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Cockayne综合征A型 | ERCC8基因突变导致TC-NER缺陷,引起转录偶联修复障碍,导致进行性神经退行性变、生长迟缓、视网膜色素变性等。 | 已明确致病 |
| 紫外线敏感综合征2型 | ERCC8突变导致光敏感,但无神经系统症状,属于UVSS2。 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | ERCC8基因多态性可能影响DNA修复能力,增加乳腺癌风险。 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | ERCC8表达水平与肺癌预后相关,可能参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.394C>T (p.Arg132*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.608A>G (p.Tyr203Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.1090C>T (p.Arg364*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
ERCC8功能缺失突变导致TC-NER缺陷,引起Cockayne综合征A型。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ERCC8存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ERCC8突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006289 (nucleotide-excision repair) | • GO:0003684 (damaged DNA binding) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005654 (nucleoplasm) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0009411 (response to UV) | • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) |
相关通路
• Nucleotide excision repair (hsa03420)
• Transcription-coupled nucleotide excision repair (TC-NER)
蛋白质功能简介
ERCC8蛋白(CSA)由396个氨基酸组成,含有WD40重复结构域,参与蛋白-蛋白相互作用。CSA是DDB1-CUL4A-RBX1 E3泛素连接酶复合物的底物识别亚基,在TC-NER中负责识别停滞的RNA聚合酶II并促进修复因子的招募。此外,CSA还参与氧化DNA损伤修复和转录调控。