ESRP2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ESRP2是调控上皮-间质转化(EMT)的关键RNA结合蛋白,在肿瘤发生和发育中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | ESRP2 |
|---|---|
| 基因全名 | epithelial splicing regulatory protein 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16q22.1 |
| NCBI Gene ID | 80004 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80004 |
| Ensembl ID | ENSG00000103067 |
| UniProt ID | Q9H6T0 |
| OMIM ID | 612658 |
| HGNC ID | 26097 |
| 基因别名 | RBM35B |
基因功能与研究简介
ESRP2(上皮剪接调节蛋白2)是RNA结合蛋白家族成员,与ESRP1共同调控上皮-间质转化(EMT)相关基因的可变剪接。ESRP2通过结合靶基因pre-mRNA上的特定序列,促进上皮亚型剪接,抑制间质亚型剪接,从而维持上皮细胞表型。ESRP2在多种上皮组织中高表达,在间质细胞中低表达。其表达失调与肿瘤侵袭转移、器官纤维化等病理过程密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | ESRP2表达下调导致EMT相关剪接改变,促进肿瘤侵袭和转移。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | ESRP2表达降低与肿瘤去分化及不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 胰腺癌 | ESRP2调控CD44等基因的可变剪接,影响肿瘤干细胞特性。 | 潜在关联 |
| 肺纤维化 | ESRP2表达下调可能促进上皮-间质转化,参与纤维化进程。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF-7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,高表达 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系,中等表达 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系,低表达 |
| PANC-1 | 暂无可靠数据 | 胰腺癌细胞系,低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1000C>T (p.Arg334Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.1502A>G (p.Gln501Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RNA结合活性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使ESRP2功能丧失,可能促进EMT和肿瘤进展。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明ESRP2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前尚无明确证据表明ESRP2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003729 (mRNA binding) | • GO:0000380 (alternative mRNA splicing |
| • via spliceosome) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005829 (cytosol) |
相关通路
• Epithelial to mesenchymal transition (EMT) pathway
• Alternative splicing regulation
蛋白质功能简介
ESRP2蛋白包含三个RNA识别基序(RRM),能够结合靶基因pre-mRNA上的GU-rich序列,调控可变剪接。ESRP2与ESRP1功能冗余,共同维持上皮细胞剪接程序。在间质细胞中,ESRP2表达下调,导致间质亚型剪接变体产生,促进细胞迁移和侵袭。