ETV1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ETS转录因子家族成员,参与神经发育和肿瘤发生,是多种癌症中的关键致癌基因。
基因信息卡
| 基因符号 | ETV1 |
|---|---|
| 基因全名 | ETS variant transcription factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7p21.3 |
| NCBI Gene ID | 2115 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2115 |
| Ensembl ID | ENSG00000106468 |
| UniProt ID | P50549 |
| OMIM ID | 600541 |
| HGNC ID | 3490 |
| 基因别名 | ER81, ETS-related protein 81 |
基因功能与研究简介
ETV1(ETS variant transcription factor 1)是ETS转录因子家族成员,含有ETS DNA结合结构域,参与调控细胞增殖、分化和凋亡等过程。在神经系统中,ETV1对神经元的发育和功能维持至关重要。此外,ETV1在多种癌症中高表达或发生基因重排,如尤文肉瘤、前列腺癌和黑色素瘤,被认为是一种致癌基因。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 尤文肉瘤 | ETV1基因与EWSR1基因融合形成EWSR1-ETV1融合蛋白,该融合蛋白作为异常转录因子驱动肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 前列腺癌 | ETV1基因重排导致其过表达,激活下游致癌信号通路,促进肿瘤进展。 | 具有较强研究证据 |
| 黑色素瘤 | ETV1过表达与黑色素瘤的发生和转移相关,可能通过调控细胞增殖和侵袭相关基因。 | 具有较强研究证据 |
| 胃肠道间质瘤 | ETV1在GIST中高表达,是肿瘤细胞增殖和存活所必需的。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胃肠道 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| PC3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| EWSR1-ETV1融合 | 基因融合 | 罕见 | 产生致癌融合蛋白,导致异常转录活性 |
| ETV1过表达 | 表达上调 | 常见于前列腺癌 | 促进肿瘤发生发展 |
| ETV1点突变 | 错义突变 | 罕见 | 功能影响尚不明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
ETV1基因融合或过表达导致功能获得,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• MAPK signaling pathway (hsa04010)
• Transcriptional regulation by RUNX1 (WP2848)
• Signaling by Receptor Tyrosine Kinases (R-HSA-9006934)
蛋白质功能简介
ETV1蛋白属于ETS转录因子家族,包含一个高度保守的ETS DNA结合结构域,能够识别并结合DNA上的ETS基序。ETV1在神经系统中高表达,参与神经元的分化和突触形成。在肿瘤中,ETV1通过基因融合或过表达激活下游靶基因,如基质金属蛋白酶和细胞周期调节因子,从而促进肿瘤侵袭和增殖。