ETV4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ETV4是ETS转录因子家族成员,参与肿瘤侵袭和转移,是癌症研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | ETV4 |
|---|---|
| 基因全名 | ETS variant transcription factor 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q21.31 |
| NCBI Gene ID | 2118 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2118 |
| Ensembl ID | ENSG00000175832 |
| UniProt ID | P43268 |
| OMIM ID | 600711 |
| HGNC ID | 3493 |
| 基因别名 | E1A-F, E1AF, PEA3 |
基因功能与研究简介
ETV4(ETS variant transcription factor 4)是ETS转录因子家族的成员,其蛋白包含ETS DNA结合结构域,能够结合DNA并调控靶基因的转录。ETV4在胚胎发育、细胞增殖、分化、迁移和凋亡等过程中发挥重要作用。在多种癌症中,ETV4表达异常升高,促进肿瘤侵袭和转移,与不良预后相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 前列腺癌 | ETV4过表达或基因融合(如TMPRSS2-ETV4)导致转录失调,促进肿瘤进展和转移。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | ETV4高表达与乳腺癌的侵袭性和转移相关,可能通过调控基质金属蛋白酶(MMPs)等基因。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | ETV4在非小细胞肺癌中表达上调,促进细胞增殖和迁移。 | 研究证据 |
| 结直肠癌 | ETV4表达升高与结直肠癌的进展和不良预后相关。 | 研究证据 |
| 胃癌 | ETV4在胃癌组织中高表达,可能通过激活下游信号通路促进肿瘤生长。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| PC3(前列腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | ETV4高表达 |
| MCF7(乳腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | ETV4中等表达 |
| A549(肺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | ETV4表达 |
| HCT116(结直肠癌细胞系) | 暂无可靠数据 | ETV4表达 |
| MKN45(胃癌细胞系) | 暂无可靠数据 | ETV4表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| TMPRSS2-ETV4融合 | 基因融合 | 常见于前列腺癌 | 导致ETV4过表达,促进肿瘤发生 |
| ETV4扩增 | 拷贝数变异 | 部分癌症中 | 导致ETV4过表达,增强致癌活性 |
| ETV4点突变 | 错义突变 | 罕见 | 功能影响尚不明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
ETV4基因融合和扩增导致过表达,属于功能获得性改变,促进肿瘤进展。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0007165 signal transduction |
| • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• MAPK signaling pathway (hsa04010)
• Rap1 signaling pathway (hsa04015)
• Proteoglycans in cancer (hsa05205)
• Pathways in cancer (hsa05200)
蛋白质功能简介
ETV4蛋白属于ETS转录因子家族,包含一个高度保守的ETS DNA结合结构域,能够识别并结合DNA上的ETS基序。ETV4通过调控下游靶基因(如MMPs、uPA等)的表达,参与细胞外基质降解、细胞迁移和侵袭等过程。在多种癌症中,ETV4的异常表达或基因融合导致其转录活性增强,促进肿瘤的恶性进展。
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