EVA1C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
EVA1C(eva-1同源物C)是一种与细胞自噬和凋亡调控相关的基因,在多种肿瘤中表达异常,可能作为潜在的肿瘤抑制因子。
基因信息卡
| 基因符号 | EVA1C |
|---|---|
| 基因全名 | eva-1 homolog C (C. elegans) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 21q22.11 |
| NCBI Gene ID | 84189 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84189 |
| Ensembl ID | ENSG00000160255 |
| UniProt ID | Q9H6Z9 |
| OMIM ID | 617447 |
| HGNC ID | 28759 |
| 基因别名 | FAM176C, TMEM166 |
基因功能与研究简介
EVA1C(eva-1 homolog C)基因编码一种跨膜蛋白,参与调控细胞自噬和凋亡。研究表明,EVA1C在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。其表达水平与肿瘤分期和预后相关,是潜在的诊断和预后标志物。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | EVA1C表达下调与肝细胞癌的进展和不良预后相关,可能通过调控自噬影响肿瘤细胞存活。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | EVA1C在乳腺癌中表达降低,可能通过抑制细胞凋亡促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | EVA1C表达下调与结直肠癌的侵袭和转移相关,可能作为抑癌基因。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | EVA1C在非小细胞肺癌中表达下调,与患者生存期缩短相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Trp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能使EVA1C失去抑癌功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明EVA1C存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明EVA1C存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006914 (autophagy) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) |
相关通路
• Autophagy pathway (KEGG: hsa04140)
• Apoptosis pathway (KEGG: hsa04210)
蛋白质功能简介
EVA1C蛋白是一种跨膜蛋白,定位于内质网和溶酶体,参与调控自噬和凋亡。在应激条件下,EVA1C表达上调,促进自噬和凋亡,从而抑制肿瘤发生。其表达下调与多种癌症的进展和不良预后相关。